Jaký konec se obvykle nachází na konci jmen enzymů?

Enzymy jsou molekuly, konkrétně proteiny, které pomáhají urychlit biochemické reakce interakcí s přísadami (reaktanty a produkty), aniž by je trvale měnily. Tento proces usnadnění je známý jako katalýzaa odpovídajícím způsobem jsou identifikovány samotné enzymy katalyzátory.

Enzymy, jako mnoho hráčů v mikrobiologie svět, může mít dlouhá a těžkopádná jména, téměř všechny končí na „-ase“. Ale pokud jste obeznámeni s formálním systémem, ve kterém jsou enzymy pojmenovány, můžete toho hodně rozluštit záhad o funkci daného enzymu, aniž bychom přesně věděli, jakou reakci tento enzym katalyzuje.

Hovorově je katalyzátorem jakákoli entita, která zlepšuje tok, účinnost nebo efektivitu daného úsilí. Pokud jste basketbalovým trenérem a víte, že uvedení daného populárního hráče do hry rozproudí dav a tým obecně, pak využíváte přítomnost katalyzátoru.

Lidské katalyzátory zajišťují, aby se věci staly, a mají tendenci přimět lidi kolem sebe, aby vypadali také maximálně zdatní. Stejným způsobem mohou biologické katalyzátory způsobit, že se určité biochemické procesy objeví téměř automaticky, pokud jsou přítomny ve skutečnosti by tyto procesy při nepřítomnosti klopýtly a potácely se po jistém závěru enzym.

Katalyzátory často nejsou zapsány do vzorce pro chemickou reakci, které se účastní, protože podle definice je katalyzátor na konci reakce nezměněn od své původní formy.

Na konci 70. let 19. století se zjistilo, že něco v kvasnicích může způsobit zdroje cukru proměnit se v alkoholické nápoje mnohem rychleji, než by mohlo nastat spontánně, a to samé princip kvašení aplikované na zrání sýra.

Pokud zůstanou samy za správných podmínek, některé druhy hnijícího ovoce mohou nakonec vést k tvorbě ethylalkoholu. Přidání droždí však nejen urychluje fermentaci, ale také přináší jak předvídatelnost, tak míru kontroly nad celou chemickou reakcí.

„Enzym“ je z řečtiny pro „s kvasinkami“. Jak se dnes používá, odkazuje na biologický katalyzátory v organismech nebo látky, které jsou produkovány jak živým systémem, tak ve prospěch živého systému.

Hlavní funkcí všech enzymů je katalyzovat metabolické procesy, ke kterým dochází v buňce. Formálnější definice enzymu specifikuje, že enzym musí nejen působit na reakce v živé buňce, ale musí být vytvořen také organismem - stejným nebo jiným -.

Jednotlivé enzymy lze popsat z hlediska jejich specifičnost. Toto je míra toho, jak exkluzivní je vztah enzymu k jeho Podklad nebo substráty. Substráty jsou molekuly, na které se váží enzymy, obvykle reaktanty. Pokud se enzym váže pouze na jeden substrát v jedné reakci, znamená to absolutní specifičnost. Když se může vázat na řadu různých, ale chemicky podobných substrátů, má enzym skupina specifičnost.

To, jak dobře fungují enzymy - tj. Jak moc jsou schopny ovlivnit reakce, na které se zaměřují ve srovnání s neutrálními podmínkami - závisí na řadě faktorů. Mezi ně patří teplota a kyselost, které ovlivňují stabilitu všech proteinů, nejen enzymů.

Jak byste očekávali, zvýšení množství substrátu může zvýšit rychlost reakce, pokud enzym již není „nasycen“; naopak, přidání enzymů může urychlit reakci na dané úrovni substrátu a může umožnit přidání více substrátu, aniž by narazilo na produkční strop.

Rychlost vymizení substrátu (a vzhled reaktantu) v reakcích, na nichž se podílejí enzymy, není lineární, ale spíše inklinuje ke zpomalení, jakmile se reakce blíží dokončení. Toto je na grafu koncentrace versus čas znázorněno sestupným sklonem, který se postupem času stává pozvolnějším.

Téměř každý seznam enzymů, které obsahují ty nejznámější a nejlépe studované, je téměř jisté, že obsahují katalyzátory v glykolýze, kyselinu citrónovou (tj. Krebs nebo kyselina trikarboxylová) cyklus nebo obojí. Tyto procesy, z nichž každá se skládá z několika jednotlivých reakcí, zahrnují rozklad glukózy na pyruvát v buňce cytoplazma a přeměna pyruvátu na rotující řadu meziproduktů, které nakonec umožňují, aby došlo k aerobnímu dýchání.

Dva enzymy účastnící se rané fáze glykolýzy jsou glukóza-6-fosfatáza a fosfofruktokináza, zatímco citrát syntáza je významným hráčem v cyklu kyseliny citronové.

Dokážete předpovědět, co by tyto enzymy mohly dělat na základě jejich jmen? Pokud ne, zkuste to znovu asi za pět minut.

Název enzymu nemusí snadno sjíždět z jazyka, ale takové jsou náklady na přijetí chemie. Většina jmen se skládá ze dvou slov, přičemž první identifikuje substrát, na který enzym působí a druhá signalizuje typ použité reakce (více o tomto druhém atributu v dalším sekce).

Ačkoli ohromný počet názvů enzymů končí na „-ase“, řada důležitých a dobře prostudovaných nikoli. Zahrnuje jakýkoli seznam enzymů týkajících se lidského trávení trypsin a pepsin. Enzymová přípona „-ase“ však sama o sobě neznamená nic jiného než skutečnost, že dotyčný protein je ve skutečnosti enzym, a neřeší funkční detaily.

Existuje šest hlavních tříd enzymů, rozdělených do kategorií na základě jejich funkce. Většina z těchto tříd zahrnuje také podtřídy. Jejich jména jsou užitečná při určování toho, co dělají, ale pouze pokud znáte řečtinu nebo latinu.

• Oxidoreduktázy jsou enzymy, které se účastní reakcí, ve kterých je buď substrát oxidovaný (tj. ztrácí elektrony) nebo snížena (tj. získá elektrony). Příklady zahrnují enzymy končící na dehydrogenáza, oxidáza, peroxidáza a reduktáza. Laktátdehydrogenáza, který katalyzuje vzájemnou přeměnu laktátu a pyruvátu v kvašení, patří do třídy oxidoreducatázy.

• Transferázy, jak naznačuje název, přenášejte funkční skupiny, spíše než jen elektrony nebo jednotlivé atomy, z jedné molekuly do druhé. Kinázy, které přidávají fosfátové skupiny k molekulám (např. přidání fosfátové skupiny k fruktóza-6-fosfátu v glykolýze) jsou příklady.

• Hydrolázy katalyzují hydrolýzní reakce, při nichž se molekula vody („hydro-“) používá k odštěpení větší molekuly („-lase“), aby se rozložila na menší. Fosfatázy, což jsou funkční protiklady kináz, to dělají odstraněním fosfátových skupin; proteázy, peptidázy a nukleázy, které štěpí molekuly bohaté na bílkoviny, jsou druhým podtypem.

• Lyázy vytvářet dvojné vazby v molekule odstraněním skupiny z atomu uhlíku. (V reverzní reakci je skupina přidána k jednomu z atomů uhlíku v dvojné vazbě, aby se transformovala na jednoduchou vazbu.) Enzymy končící na dekarboxyláza, hydratáza, syntáza a lyáza samotné jsou příklady.

• Izomerázy katalyzovat izomerační reakce, které jsou přesmyky molekuly za vzniku izomer, molekula se stejným počtem a druhy atomů (tj. se stejným chemickým vzorcem), ale s jiným tvarem. Jedná se tedy o druh transferázy, ale místo toho, aby pohybovaly skupinami mezi molekulami, dělají to uvnitř molekul. Izomeráza, mutáza a racemase enzymy spadají do této třídy.

• Ligázy katalyzují tvorbu vazby procesem ATP hydrolýza, spíše než přesunem atomu nebo skupiny z jednoho místa na druhé. Karboxyláza syntetáza je příkladem a ligázový enzym.