Močovina je sloučenina, která je vysoce aktivní v různých biologických procesech v lidském těle i v jiných savcích a organismech. Zabývá se odstraňováním přebytečného dusíku v lidském těle a působí jako prostředek při denaturaci bílkovin. Močovina patří do třídy sloučenin známých jako chaotropní denaturanty, které rozkládají terciární strukturu proteinů destabilizací vnitřních nekovalentních vazeb mezi atomy.
Proteiny mohou být denaturovány močovinou několika procesy. Jedna metoda zahrnuje přímou interakci, při níž se vodík močoviny váže na polarizované oblasti náboje, jako jsou peptidové skupiny. Tento vzájemný vliv oslabuje mezimolekulární vazby a interakce a oslabuje celkovou sekundární a terciární strukturu. Jakmile dojde k postupnému odvíjení proteinu, voda a močovina budou mít snadnější přístup k hydrofobnímu vnitřnímu jádru daného proteinu, což urychlí proces denaturace.
Močovina může také denaturovat proteiny nepřímo, a to prostřednictvím ovlivnění vlastností rozpouštědla, ve kterém jsou proteiny ponořeny. Změnou struktury a hydrodynamiky samotného rozpouštědla, podobně jako přidání nepolární rozpuštěné látky do směsi, podporuje močovina destabilizaci vnitřních vazeb. Pak by se ukázalo, že přímá interakce močoviny s proteinem prostřednictvím vodíkové vazby je pravděpodobným začátkem rozpadu proteinu. Nepřímé interakce rozpouštědla a rozpuštěné látky pomáhají procesu postupovat a tvoří cestu k této přímé interakci. Močovina může také denaturovat proteiny nepřímo, a to prostřednictvím ovlivnění vlastností rozpouštědla, ve kterém jsou proteiny ponořeny. Změnou struktury a hydrodynamiky samotného rozpouštědla, podobně jako přidání nepolární rozpuštěné látky do směsi, podporuje močovina destabilizaci vnitřních vazeb. Pak by se ukázalo, že přímá interakce močoviny s proteinem prostřednictvím vodíkové vazby je pravděpodobným začátkem rozpadu proteinu. Nepřímé interakce rozpouštědla a rozpuštěné látky pomáhají procesu postupovat a tvoří cestu k této přímé interakci.
Přesný způsob, jakým močovina degraduje bílkoviny, je stále předmětem tajemství. Výzkum tohoto předmětu ukázal, že pravděpodobnou odpovědí je s největší pravděpodobností kombinace výše jmenovaných faktorů. Experimentální metody jsou nepravděpodobným zdrojem získávání poznatků o tom, jak jsou proteiny denaturovány močovinou. Budoucí výzkum a zdokonalení mikroskopie na atomové úrovni bezpochyby vnesou do této problematiky více světla a odhalí přesný mechanismus, kterým dochází k denaturaci proteinu močovinou.