Struktura dvouvláknové DNA je univerzální ve všech živých buňkách, ale existují rozdíly v metodách extrakce genomové DNA ze živočišných a rostlinných buněk. Ačkoli genomová DNA žije v jádru buněk, množství a čistota extrahované DNA závisí na typu a velikosti buňky. Například některé buňky obsahují více DNA a nečistot než jiné. Čtěte dále a dozvíte se více o rozdílech v extrakci DNA.
Obecná extrakce DNA
Pokud ošetříte rostlinné a živočišné buňky mýdlovou látkou, rozloží se lipidy v buňkách a jaderné membrány. Poté se směs DNA oddělí od buněčných membrán a proteinů. Dále můžete použít alkohol k vysrážení DNA v roztoku. V závislosti na množství ve vzorku může být DNA viditelná pouhým okem. Mějte však na paměti, že tento jednoduchý postup nemusí nutně produkovat DNA vysoké čistoty.
Rostlinné a živočišné buňky
Rostlinné buňky se liší od živočišných tím, že mají tuhou buněčnou stěnu a organely jako chloroplast. Obsahují také bílkoviny a enzymy, které hrají roli ve fotosyntéze. Některé rostlinné buňky mají polyploidii, což znamená, že mají více než jednu kopii každého chromozomu na buňku. Kromě toho buněčné procesy vyskytující se v rostlinách, jako je fotosyntéza, produkují řadu sekundárních metabolitů. Živočišné buňky nemají buněčnou stěnu, stále však potřebují chemikálie, jako je dodecylsulfát sodný (SDS), aby narušily buněčnou membránu a uvolnily genomovou DNA.
Extrakce rostlinné DNA
Genomická DNA rostlin je těžší získat kvůli buněčné stěně rostliny. Můžete jej odstranit homogenizací nebo přidáním celulázy, abyste rozložili celulózu, která tvoří buněčnou stěnu. Kromě toho mohou metabolity přítomné v rostlinné buňce interferovat s extrakcí genomové DNA kontaminací vzorku DNA během procesu srážení.
Extrakce zvířecí DNA
Leukocyty v periferní krvi jsou hlavním zdrojem genomové DNA zvířete, ale odběr vzorků je obtížný, protože krev musí pocházet přímo ze zvířete. Krev obsahuje řadu sloučenin, jako jsou bílkoviny, lipidy, bílé krvinky, červené krvinky, krevní destičky a plazma, které mohou kontaminovat vzorek DNA. Primárním kontaminantem zvířecí DNA extrahované ze vzorků krve je však hem, který je neproteinovou složkou hemoglobinu.
Rozdíly DNA
Rozdíly mezi rostlinnou a zvířecí DNA spočívají v sekvenci bází ve šroubovici. Sloučeniny nalezené v rostlinných buňkách chybí ve zvířecích buňkách a odráží to sekvence bází DNA. Také genomová rostlinná DNA je často větší než zvířecí DNA. Tyto rozdíly také ovlivňují extrakční metody, výtěžek a čistotu DNA.