Jak vypočítat interference

Chromozomální crossover, nazývaný také genetický crossover, je normální proces, při kterém se geny rekombinují. Rekombinace zvyšuje genetickou variabilitu rekombinací za vzniku různých vlastností.

TL; DR (příliš dlouhý; Nečetl)

Genová interference je mírou nezávislosti crossoverů na sobě navzájem. Pokud crossover v jedné oblasti ovlivní crossover v jiné oblasti, tato interakce se nazývá interference. Interference = 1 - c.o.c., kde c.o.c. je koeficient shody (c.o.c.)

Lidé mají 23 chromozomů. Během meiózy se jedna buňka dělí dvakrát a tvoří čtyři dceřiné buňky. Tyto čtyři dceřiné buňky mají poloviční počet chromozomů mateřské buňky. Poté se mohou připojit k další chromozomální polovině z vajíčka nebo spermatu, aby se z nich stal celý pár.

Někdy tyto dvě části nezůstanou pohromadě. Pokud se kousky rozbijí, mohou se spojit s dalším rozbitým kouskem. Dvě genetické kopie, které se rekombinují, se nazývají chromatidy. Problémy, jako je Downův syndrom nebo jiné genetické poruchy, mohou být způsobeny nesprávnou kombinací genů.

Většina výhybek se vyskytuje normálně. Občas dojde k dvojitému přechodu. To je případ, kdy se chromatidy spojí dohromady ve dvou bodech místo v jednom. Ve druhém kontaktním bodě se chromatidy mohou znovu oddělit a znovu si vyměnit genetickou informaci.

Genová interference je mírou nezávislosti crossoverů na sobě navzájem. Jinými slovy, protože víte, že dochází k dvojitým křížením, musíte odpovědět na otázku, zda jsou křížení v sousedních oblastech chromozomů nezávislá nebo ne. Pokud nejsou nezávislé, znamená to, že přechod v jedné oblasti ovlivňuje pravděpodobnost, že dojde k přechodu v sousední oblasti. Pokud crossover v jedné oblasti ovlivní crossover v jiné oblasti, tato interakce se nazývá interference.

Jak vypočítat interference

Při zvažování, jak vypočítat interferenci, je prvním krokem výpočet koeficientu shody (c.o.c.). Spol. S r.o. zase závisí na pravděpodobnosti dvojitého křížení, které se nazývá hodnota frekvence křížení, známá také jako „frekvence dvojitých rekombinantů“.

Koeficient shody je poměr pozorovaných a očekávaných dvojitých rekombinantů.

Koeficient shody = frekvence pozorována u dvojitých rekombinantů / frekvence očekávaná u dvojitých rekombinantů

Očekávaný počet dvojitých rekombinantů ve vzorku dvou nezávislých oblastí se rovná součinu rekombinantních frekvencí v sousedních oblastech.

Rušení je pak definováno takto:

interference = 1 - c.o.c.

Interference vám říká, jak silně křížení v jedné z oblastí DNA interferuje s tvorbou křížení v druhé oblasti.

Pokud je interference nulová, znamená to, že k dvojitým křížením dochází podle předpovědi a že křížení v jedné oblasti nastává nezávisle na křížení v sousední oblasti.

Pokud je interference 1, znamená to, že interference je úplná a že nedochází k dvojím křížením pozorováno, protože výhybka v jedné oblasti eliminuje pravděpodobnost výhybky v sousední oblasti kraj.

Typicky budou vaše data vykazovat interference mezi 0 a 1. Hodnoty vyšší než nula, ale nižší než jedna znamenají, že dochází k rušení.

  • Podíl
instagram viewer