Transmisní elektronový mikroskop (TEM) a rastrovací elektronový mikroskop (SEM) jsou mikroskopické metody pro prohlížení extrémně malých vzorků. TEM a SEM lze srovnávat v metodách přípravy vzorků a aplikacích každé technologie.
Oba typy elektronových mikroskopů bombardují vzorek elektrony. TEM je vhodný pro studium vnitřku objektů. Barvení poskytuje kontrast a řez poskytuje ultra tenké vzorky pro vyšetření. TEM je vhodný pro vyšetřování virů, buněk a tkání.
Vzorky vyšetřované pomocí SEM vyžadují vodivý povlak, jako je zlato-palladium, uhlík nebo platina, aby sbíraly přebytečné elektrony, které by zakrývaly obraz. SEM je vhodný pro prohlížení povrchu předmětů, jako jsou makromolekulární agregáty a tkáně.
Elektronové dělo produkuje proud elektronů, které jsou zaostřeny kondenzátorovou čočkou. Kondenzovaný paprsek a přenášené elektrony jsou zaostřeny objektivem do obrazu na obrazovce s fosforovým obrazem. Tmavší oblasti obrazu naznačují, že bylo přeneseno méně elektronů a že tyto oblasti jsou silnější.
Stejně jako u TEM je elektronový paprsek produkován a kondenzován čočkou. Toto je objektiv kurzu na SEM. Druhá čočka formuje elektrony do úzkého tenkého paprsku. Sada cívek skenuje paprsek podobným způsobem jako v televizi. Třetí čočka směruje paprsek do požadované části vzorku. Paprsek může přebývat v určitém bodě. Paprsek může skenovat celý vzorek 30krát za sekundu.