Mikroskop existuje už velmi dlouho. Technologie, která byla vynalezena v 16. století, se od té doby neustále zdokonaluje. Mikroskop, který již dávno překonal jednoduchý klasický model skleněné trubice, se dnes používá v různých kontextech v různých průmyslových odvětvích, jako je automobilový a farmaceutický průmysl. Přirozené limity lidského oka se neustále zvyšují, aby splnily základní úkoly průmyslu.
Části složitých moderních strojů, jako jsou automobily, se staly tak malými, že použití mikroskopu je nevyhnutelné. Pomocí mikroskopu speciálně navrženého pro tento úkol mohou inženýři vyhodnotit i nejmenší ozubené kolo z hlediska vad a zlomenin. Mikroskopy se tímto způsobem také používají ke kontrole částí strojů, jako jsou hodinky, a motorů používaných k pohonu lodí a letadel.
Inženýrství materiálů je stále složitější, protože jsou vyvíjeny nové materiály pro nejrůznější úkoly. Pomocí speciálně navržených materiálů inženýři vylepšili vše od konstrukce budovy přes obalový materiál až po oblečení, které lidé nosí. Mikroskop má v tomto procesu zásadní význam, protože umožňuje odborníkům kontrolovat velmi základní formy materiálů, které vytvářejí. Použití mikroskopu bude s novými nanomateriály ještě důležitější.
Mikroskopy byly vždy rozhodujícím nástrojem v lékařské profesi. Mikroskopy umožnily světově proměnlivý objev teorie zárodků, který zachránil nespočet životů. Dnes se mikroskopy používají při pozorování bakterií a mikrobů, jakož i při vývoji nových chemických látek a léků používaných v boji proti chorobám. Vývoj nových léků velmi napomáhá použití vysoce výkonných mikroskopů.