Patogenní bakterie v půdě

Patogeny jsou mikroby, které způsobují onemocnění jejich hostitelů. Zatímco rostliny se obvykle mají více obávat z půdních patogenních hub než z půdních bakteriálních chorob, řada patogenních bakterií, které žijí v půdě, způsobuje onemocnění také u rostlin. Existuje příliš mnoho druhů patogenů půdních rostlin, abychom je mohli vyjmenovat všechny, ale následující jsou některé z nejdůležitějších nebo nejběžnějších. Několik druhů bakterií v půdě se může ukázat jako nebezpečné nebo dokonce smrtelné i pro člověka.

C. botulinum je grampozitivní bakterie (tj. bakterie, která má pozitivní test na Gramově barvení), která tvoří odolné a trvanlivé spory. Když spory naleznou správné podmínky, vyklíčí a začnou růst. Mohou produkovat smrtelný protein zvaný botulotoxin, který působí na nervový systém u lidí a jiných savců a blokuje uvolňování klíčového neurotransmiteru nazývaného acetylcholin. C. botulinové spory se nacházejí v půdě a vodě v mnoha oblastech po celém světě. Jsou anaerobní a rostou pouze v nepřítomnosti kyslíku; kyselé podmínky inhibují jejich růst. Ačkoli C. botulinum někdy způsobuje smrtelné případy nemoci přenášené potravinami zvané botulismus, silný toxin produkovaný bakterie se také stala užitečnou pro paralyzování svalové tkáně u lidí jako součást různých lékařských nebo kosmetických prostředků postupy. Když se botulotoxin používá jako terapeutické činidlo, je známý pod svým obchodním názvem Botox.

E. carotovora je vysoce ničivý patogen, který způsobuje nemoci u celé řady rostlin, včetně brambor a většiny masité zeleniny. Tato gramnegativní bakterie ve tvaru tyčinky může napadnout plodiny na poli nebo při skladování. Poddruh E. carotovora carotovora dobře přežívá v půdě a povrchových vodách; může růst v kořenových zónách mnoha jiných nehostitelských plodin nebo dokonce druhů plevelů, napadajících brambory nebo jiné zranitelné plodiny, pokud to příležitost nabízí. Běžné choroby brambor způsobené E. carotovora zahrnuje černou nohu, hnilobu kmene a měkkou hnilobu hlíz.

Svrab Streptomyces je grampozitivní bakterie, která spolu s dalšími dvěma druhy Streptomyces (S. acidiscabies a S. turgidiscabies) může infikovat brambory a jiné okopaniny, jako je řepa, ředkvičky, tuřín, mrkev a pastinák. Je to neobvyklé v tom, že když rostou, buňky vytvářejí vlákna podobná těm, která tvoří houby - i když mnohem menší. Vlákna S. svrab se pak může odlomit a vytvořit spory. Bakterie se šířily napadáním mladých, čerstvých tkání a vstupem do starších tkání prostřednictvím ran nebo přirozených otvorů.

Xanthomonas je rod, který zahrnuje mnoho důležitých rostlinných patogenů. Ačkoli v půdě nepřetrvávají příliš dlouho, některé druhy mohou v půdě přežít přes zimu a na jaře infikovat novou úrodu. Stejně jako všechny ostatní proteobakterie jsou gramnegativní. Druh X. campestris způsobuje černou hnilobu v široké škále rostlin a je možná nejdůležitějším členem rodu. Je ironií, že stejná bakterie se komerčně pěstuje za účelem výroby xanthanové gumy, běžné přísady do potravin.