Днес са разработени различни експресионни системи и те са много добре установени в търговската мрежа, особено за получаване на рекомбинантни протеини. Използваните експресионни системи включват култури на бозайници и насекоми, ешерихия коли и бактерии. Изразът в бацил е видната система, която се използва. Фердинанд Кон е първият, който описва рода Bacillus през 1872 г. и те включват голям брой грамположителни бактериални видове като Bacillus subtilis, Bacillus anthracis, Bacillus megaterium и Бацил.
Bacillus Subtilis
Bacillus subtilis е грам-положителна бактерия, често срещана в почвата и съдържа само една мембрана, което я прави идеална рамка за секреция на органични молекули. Bacillus subtilis е привлекателен гостоприемник за производството на протеини, тъй като има способността да секретира извънклетъчни ензими директно в хранителната среда. Освен това има голям отделителен капацитет. Bacillus subtilis се използва за подобряване на качеството и количеството на секретираните чужди протеини като интерферон, растежен хормон, пепсиноген и епидермален растежен фактор. Б. обаче subtilis произвежда и секретира високи нива на извънклетъчни протеази, които разграждат секретираните чужди протеини. Бацилът също няма добре регулирани индуцируеми вектори, което ограничава широкото приложение на B. система subtilis.
Bacillus Anthracis
Bacillus anthracis е грам-положителна спорообразуваща бактерия, която обитава почвата. При влизане в човешки гостоприемник той може бързо да се размножава и да причини антракс, заболяване, включващо товемия и септицемия. Пример за негативните ефекти на Bacillus anthracis е потенциалното му използване в биологичната война, както е показано в пощенската система на САЩ през 2001 г. Капсулата, определяща гена, и токсичните фактори, отговорни за антракса, са разположени на два плазмида, pXO1 и pXO2 и транскрипцията на тези гени се активира от регулатора AtxA по време на вегетация умножение. Изследванията на Bacillus anthracis са съсредоточени предимно върху експресията на гени, свързани с най-установения фактор на вирулентност, антракс токсин, съставен от защитни антигени (PA). Защитният антиген на Bacillus anthracis е основният защитен имуноген в сегашната човешка ваксина срещу антракс.
Bacillus Megaterium
Bacillus megaterium е един от най-големите бацили, открити в почвата. Той се намира в много екологични ниши, защото расте в голямо разнообразие от въглеродни запаси. Б. експресионната система на мегатериум осигурява гъвкав и лесен за работа инструмент за стабилно и високо добивно производство на протеин. Това се дължи на няколко причини; първо, Б. megaterium не притежава алкални протеази, което му позволява да бъде добро клониране и експресия на чужди протеини без разграждане. На второ място, бактерията лесно секретира протеини в растежната среда и трето, в клетъчната стена не се откриват ендотоксини. Той произвежда разнообразни ензими, като амилаза, използвана в производството на хляб, и пеницилин амидаза, използвана за производството на антибиотици.
Бацил Бревис
Bacillus brevis се използва успешно за производството на хетероложни протеини (протеини, които се различават по структура). Не са правени много изследвания за bacillus brevis, но е известно, че произвеждат разтворими протеини, които са неразтворими, когато се произвеждат от E. коли система. Освен това е безопасен домакин, който е лесен за култивиране и стерилизация. Основният недостатък, който ограничава използването му, е ниският добив на протеин.