Микробиологията е изследване на микробите. "Микроб" е термин, който включва всички едноклетъчни организми - бактериите и археите, протистите и някои гъби; няколко много малки многоклетъчни организми; и неорганичните живи явления, вируси, приони, вириони и вироиди. Много микроскопични организми образуват колонии. Всички индивиди в някои колонии произхождат от една и съща родителска клетка. В други свободно живеещите индивиди се събират, за да образуват колонии на определени етапи от жизнения цикъл.
Виждайки невидимото
Докато колониите са изградени от микроскопични образувания, самата колония често е видима. Микробиологията използва клетъчна култура - умишлен растеж на колонии, особено на бактерии и гъбички - за изследвания и диагностика. Това включва поставяне на проби от микроби или инфекциозен материал в разтвор върху плочи с растежна среда и инкубирането им за определен период. След това микробиологът изследва цвета, формата, ръбовете и повърхностните характеристики на колониите като първата стъпка при идентифицирането на микробите.
Агент и домакин
Ешерихия коли е много разпространена колониеобразуваща бактерия. Обикновено присъства в червата на много гръбначни животни и в изпражненията на повечето гръбначни животни, но някои вирулентни щамове причиняват тежко заболяване. Д. coli колонии са позната характеристика на микробиологичните лаборатории поради значението на тази бактерия за здравето на хората и животните. Те също се използват за изследване на активността на различни вируси, тъй като E. coli клетките са жертви на други микроби.
Водна общност
Carchesium са род ресничести сладководни и морски протозои. Те се събират в колонии, подобни на дървета, стига да са напълно видими осми от инча. Колониите са съставени от стотици индивиди, които се движат заедно като един организъм. Колониите предпочитат да се прикрепят към разлагащите се растителни вещества, където се хранят с бактерии, но те ще се образуват на други повърхности, включително кожите на живите морски животни.
Водна слуз
Хлорофитите са едноклетъчни сладководни зелени водорасли. Те могат да образуват колонии, които приличат на живи листове зелена или червена слуз върху потопени предмети или на повърхността на водата. Hydrodictyon е род колониален хлорофит. Нарича се „водна мрежа“ и колонии от много по-малки, нови клетки се образуват вътре в гигантски, разширяващи се родителски клетки, които сами могат да образуват колонии.
Пешеходна слуз
Формите за слуз включват три несвързани фили, всички класифицирани като протисти, въпреки че някои са многоклетъчни. Те прекарват младостта си като свободно живеещи, подобни на амеби индивиди. Въпреки това, при определени условия тези индивиди се събират, за да образуват едно цяло, с различни части на тялото, образувани от различни бивши амебоиди. Мухълът от плесен отдавна се счита за непрекъснат пример за колониални микроорганизми, но по-нататъшното проучване го прави разкри, че колониалните етапи са много по-сходни с многоклетъчните организми, отколкото с други микробни колонии.