البكتيريا هي كائنات صغيرة وحيدة الخلية مفيدة وضارة للبشر. تساعدنا بعض أشكال البكتيريا على العيش ، مثل تلك التي تساعد على تكسير الطعام في أمعائنا. يمكن للأشكال الأخرى ، مثل البكتيريا التي تسبب الطاعون الدبلي ، أن تقتل الشخص إذا تُركت دون علاج. هناك العديد من أنواع البكتيريا المختلفة وهي تتنفس باستخدام طرق مختلفة. الطريقتان الأساسيتان للتنفس البكتيري هما التنفس الهوائي والتنفس اللاهوائي.
تتطلب أشكال البكتيريا التي تتنفس بالهواء المضغوط الأكسجين لتعيش. يستخدمون الأكسجين كوقود للمساعدة في حرق الطاقة وتزويدهم بالطاقة اللازمة للحياة. هذا النوع من التنفس البكتيري هو نفس النوع الذي يستخدمه البشر ، ومن هنا جاء مصطلح "التمارين الهوائية". المنتج الثانوي الرئيسي للتنفس الهوائي من البكتيريا هو ثاني أكسيد الكربون.
تتنفس أنواع كثيرة من البكتيريا اللاهوائية. بمعنى آخر ، يمكن أن يمروا بعملية التنفس دون وجود الأكسجين. بدلاً من استخدام الأكسجين لمساعدتهم على حرق الطاقة في طعامهم ، تستخدم هذه الأنواع من البكتيريا مواد كيميائية أخرى تحدث بشكل طبيعي لإنشاء تفاعلات كيميائية وإطلاق الطاقة التي يحتاجون إليها. تشتمل المواد الكيميائية الشائعة التي تحدث بشكل طبيعي على النترات والكبريتات وثاني أكسيد الكربون. ينتج التنفس اللاهوائي في البكتيريا عمومًا العديد من المنتجات الثانوية. يمكن أن تكون العديد من هذه المنتجات الثانوية سامة أو خطرة على البشر وتشمل الإيثانول والهيدروجين.