توفر النظم البيئية للغابات المطيرة موطنًا لبعض مجتمعات الحيوانات الأكثر كثافة وتنوعًا على وجه الأرض. ومع ذلك ، يتم استغلال الغابات المطيرة باستمرار لمواردها الغنية. الممارسات البشرية مثل التعدين وإزالة الغابات لها آثار خطيرة على هذه الموائل ، مما يتسبب في فقدان عدد لا يحصى من أنواع الحيوانات لمنازلها بمعدل ينذر بالخطر.
طيور
العديد من أنواع الطوقان والببغاوات والطيور الاستوائية الأخرى في الغابات المطيرة في أمريكا الجنوبية والوسطى مهددة بالانقراض بسبب قطع الأشجار وغيرها من أسباب إزالة الغابات. نسر الخطاف ، أحد أكبر أنواع النسور المعروفة في جميع أنحاء العالم ، يزدهر في الأراضي المنخفضة للغابات الاستوائية المطيرة من جنوب المكسيك إلى شرق بوليفيا. يتقلص موطن هذا الطائر باستمرار بسبب ممارسات إزالة الغابات الواضحة وكذلك تدمير مواقع التعشيش من الممارسات الصناعية مثل التعدين والتنقيب عن النفط. يهدد فقدان الموائل أيضًا آلاف أنواع الطيور المهاجرة. تنتقل هذه الأنواع شمالًا خلال صيف أمريكا الشمالية وتعود إلى المناطق الاستوائية خلال الشتاء ؛ المزيد والمزيد من العائدين كل عام للعثور على منزل و / أو مواقع التعشيش المدمرة.
الثدييات
تفقد مجموعة كبيرة من أنواع الثدييات منازلها في الغابات المطيرة ، من أصغر القوارض إلى أكبر حيوان مفترس. تحتاج العديد من الثدييات الأكبر حجمًا إلى مساحة كبيرة للبحث عن الطعام و / أو الصيد. مع تقدم الممارسات الصناعية في مناطق معينة ، يجب أن تحصر ثدييات الغابات المطيرة مثل الغوريلا والجاغوار والبوما نفسها في موائل مجزأة ذات موارد غير كافية. تؤثر إزالة الغابات بشكل مباشر على الثدييات الشجرية (تلك التي تعيش في الأشجار) ، مثل السنجاب الطائر وخفاش الفاكهة ، بالإضافة إلى العديد من أنواع القرود. تُترك مجتمعات بأكملها بلا مأوى ، مما يجبرها على التكيف مع البيئات الخالية من الأشجار والتي لم يكونوا مستعدين لها.
الزواحف والبرمائيات
توفر إزالة الغابات السبب الرئيسي لفقدان الموائل لمعظم زواحف الغابات المطيرة ، في حين أن العديد من أنواع البرمائيات تفقد منازلها أيضًا بسبب ممارسات التنقيب عن النفط والتعدين التي تلوث البرك والأنهار والجداول ، مما يجبرهم على إيجاد مصادر جديدة للمياه لأنماط حياتهم شبه المائية. تشمل الأنواع المهددة والمهددة بالانقراض من الزواحف والبرمائيات الضفدع الذهبي ، والبراص النهاري في مدغشقر والإغوانا ، بالإضافة إلى العديد من أنواع الضفادع السامة ، وعلى الأخص تلك الموجودة في كولومبيا.