تشتهر ماليزيا بتنوعها البيولوجي ، وهي موطن لـ 15000 نبات مزهر. ومع ذلك ، تتعرض النباتات والحيوانات في البلاد لتهديد شديد وشهدت استنزافًا بنسبة 70 في المائة للنمو الأصلي. وفقًا للقائمة الحمراء للاتحاد الدولي للحفاظ على الطبيعة (IUCN) ، يوجد في ماليزيا 686 نوعًا من النباتات المهددة بالانقراض اعتبارًا من عام 2007. تحمي القوانين الماليزية الطيور والثدييات والحشرات. لا تتم حماية النباتات والحيوانات إلا إذا نمت داخل حديقة أو محمية وطنية.
أنواع الغابات الرئيسية في ماليزيا هي Giam Kanching أو غابة dipterocarp النادرة ، وغابات المنغروف ، وغابات مستنقعات الخث ، والغابات الجبلية الجبلية ، وفقًا للصندوق العالمي للحياة البرية. تنمو شجرة dipterocarp ، المعروفة بثمارها ذات البذور ثنائية الجناحين ، على الأرض التي تقع فوق مستوى سطح البحر مباشرةً على ارتفاع 900 متر تقريبًا. تم تدمير غابات dipterocarp في الأراضي المنخفضة ، والتي توجد على ارتفاع يصل إلى 300 متر فوق مستوى سطح البحر ، بسبب الزراعة والأنشطة الأخرى كثيفة الاستخدام للأراضي. في حين تتم حماية جيب من أشجار dipterocarp في محمية غابة Kanching ، يعتبر هذا النوع مهددة بالانقراض - على وشك الانقراض - على القائمة الحمراء.
ينمو هذا النبات الاستوائي اللاحم فقط في الغابات المطحونة على ارتفاع 2000 إلى 2600 متر على جبل تروس مادي في بورنيو. يحتوي نبات Nepenthes macrophylla على أوراق على شكل إبريق تتدلى من كروم يبلغ طولها عشرة أمتار. تنزلق الحشرات من الجزء العلوي الشمعي للزهرة إلى حوض من الأحماض التي تفرزها الغدد في الجزء السفلي من الزهرة ، وفقًا لمراجعة ASEAN للتنوع البيولوجي والحفاظ على البيئة. صنفت القائمة الحمراء للـ IUCN الـ Nepenthes macrophylla على أنها مهددة بالانقراض.
تعتبر Taxitheliella richardsii مهددة بالانقراض على القائمة الحمراء ، وهي طحلب من عائلة Sematophyllaceae وموطنها الأصلي ماليزيا. المنطقة الوحيدة المعروفة (أقل من 10 كيلومترات مربعة) حيث تم العثور على الطحالب هي ساراواك ، وهي ولاية ماليزية في شمال غرب بورنيو. تنمو Taxitheliella richardsii على الكروم الخشبية والأشجار المتعفنة في الغابات شبه الاستوائية ، وهي موطن يختفي بسبب حصاد الأخشاب وقطع الأشجار.