Структура дволанцюжкової ДНК універсальна у всіх живих клітинах, однак різняться способи вилучення геномної ДНК із клітин тварин і рослин. Хоча геномна ДНК живе в ядрі клітин, кількість і чистота вилученої ДНК залежить від типу та розміру клітини. Наприклад, певні клітини містять більше ДНК та домішок, ніж інші. Читайте далі, щоб дізнатись більше про відмінності у виділенні ДНК.
Загальна екстракція ДНК
Якщо обробити клітини рослин і тварин мильною речовиною, це погіршить ліпіди в клітині та ядерних мембранах. Потім суміш ДНК відокремиться від клітинних мембран і білків. Далі можна використовувати спирт для осадження ДНК у розчині. Залежно від кількості у зразку, ДНК може бути видно неозброєним оком. Однак майте на увазі, що ця проста процедура не обов’язково дає ДНК високої чистоти.
Рослинні та тваринні клітини
Рослинні клітини відрізняються від клітин тварин своєю жорсткою клітинною стінкою та органелами, як хлоропласт. Вони також містять білки та ферменти, які відіграють певну роль у фотосинтезі. Деякі рослинні клітини мають поліплоїдію, тобто вони мають більше однієї копії кожної хромосоми на клітину. Крім того, клітинні процеси, що відбуваються в рослинах, такі як фотосинтез, виробляють цілий ряд вторинних метаболітів. Клітини тварин не мають клітинної стінки, але їм все одно потрібні хімічні речовини, такі як додецилсульфат натрію (SDS), щоб порушити клітинну мембрану і виділити геномну ДНК.
Екстракція ДНК рослин
Геномну ДНК рослин важче виділити через клітинну стінку рослини. Ви можете видалити його гомогенізацією або додаванням целюлази, щоб розщепити целюлозу, з якої складається клітинна стінка. Крім того, метаболіти, наявні в рослинній клітині, можуть перешкоджати екстракції геномної ДНК, забруднюючи зразок ДНК під час процесу осадження.
Екстракція ДНК тварин
Лейкоцити периферичної крові є основним джерелом геномної ДНК тварин, але збір зразків утруднений, оскільки кров повинна надходити безпосередньо від тварини. Кров містить ряд сполук, таких як білки, ліпіди, білі кров'яні клітини, еритроцити, тромбоцити та плазма, які можуть забруднювати зразок ДНК. Однак основним забруднювачем ДНК тварин, вилученим із зразків крові, є гем, який є небілковим компонентом гемоглобіну.
Відмінності ДНК
Відмінності між ДНК рослин і тварин полягають у послідовності основ у спіралі. Сполуки, знайдені в рослинних клітинах, відсутні в клітинах тварин, і послідовності основ ДНК це відображають. Крім того, геномна ДНК рослин часто більша за ДНК тварин. Ці відмінності також впливають на методи екстракції, вихід та чистоту ДНК.