Як розрахувати ізоелектричну точку пептидів

Пептиди - це короткі полімерні фрагменти, що складаються з амінокислот. Кожен пептид має певну амінокислотну послідовність, позначену трибуквенним або однобуквеним кодом; наприклад, амінокислота аланін скорочується як "Ala" або "A." Заряд пептидів у розчині залежить від кислотності розчину. Ізоелектрична точка (pI) відноситься до значення кислотності розчину, при якому молекула пептиду має чистий заряд нуля. Розчинність пептиду мінімальна в ізоелектричній точці. Використовуйте доступні веб-сервери для розрахунку значення pI для пептидної амінокислотної послідовності.

Напишіть пептидну послідовність, використовуючи однобуквенний код. Наприклад, якщо пептид має амінокислотну послідовність Ala-Ser-Glu-Leu-Pro (аланін — серин — глюматична кислота — лейцин — пролін), тоді послідовність з однієї літери "ASELP". При необхідності зверніться до таблиці перетворення трьох літер в одну букву, наведену в Ресурси.

Наприклад, використовуйте будь-який веб-браузер, Internet Explorer або Firefox, щоб перейти до сервера, який обчислює ізоелектричну точку пептиду (pI); див. Ресурси.

Зчитайте значення ізоелектричної точки (pI), подане в рядку "Теоретичні pI / Mw". У нашому прикладі pI дорівнює 4,00. Зверніть увагу, що сервер також обчислює молекулярну масу (Mw) пептиду.

Про автора

Оксана Фокс - позаштатна письменниця, яка спеціалізується на медицині та лікуванні, комп’ютерному програмному та апаратному забезпеченні, цифровій фотографії та фінансових послугах. Закінчила Московський медичний коледж у 1988 році, отримавши офіційну підготовку з педіатрії.

Фото кредити

Comstock Images / Comstock / Getty Images

  • Поділитися
instagram viewer