Хвойні дерева мають два типи шишок: конус пилку та конус насіння. Деякі хвойні дерева мають обидва типи конусів на одному дереві, що дає можливість дереву запилюватись. Перехресне запилення відбувається, коли одне дерево виробляє лише насіннєві шишки, і тому його потрібно запліднювати шляхом пилку, що дрейфує до насіннєвих шишок від пилкових шишок, розташованих на інших сусідніх деревах.
Пилкові шишки характерно менші та ширші від насіннєвих. Пилкові шишки, як правило, в’януть і гинуть після того, як пилок всередині конусів звільниться для запліднення насіннєвих шишок. У фазі спокою брунька хвойних порід може бути чоловічою, жіночою або вегетативною. Розрізнити типи бутонів на цьому етапі можливо лише за допомогою розсічення. Один підказка, яка може допомогти в ідентифікації конусів пилку - це його місце розташування. Насіннєві шишки, як правило, розвиваються вище на дереві, щоб допомогти у розповсюдженні після того, як насіння запилюються.
Шишки насіння зазвичай використовують для ідентифікації типу дерева, оскільки вони залишаються на дереві або під ним протягом більш тривалого періоду часу. Тонкі бруньки насіннєвої конуси набрякають протягом чотирьох-шести тижнів, поки не почнуть з’являтися червоні або зелені кінчики яйцеклітинні луски. Ваги, як правило, складаються вертикально від основи конуса, а потім опускаються вниз, приймаючи пилок із конусів пилку, щоб ініціювати розвиток насіння та сигналізувати про зрілість конусів.
Деякі хвойні дерева не мають ні пилку, ні шишок насіння. Натомість дерево дає плоди, які частково покривають насіння. Канадський тис - приклад хвойного дерева, що виробляє аріл, який містить м’ясистий покрив, що містить насіння дерева. Для того, щоб запобігти надмірній втраті насіння через хижаків тварин та птахів, які, можливо, захочуть харчуватися плоди тису, це дерево пристосувалося так, що його плоди токсичні, а насіння залишаються безперешкодно.
Хвойні породи, що несуть конуси, або пінофіти, класифікуються як голонасінні (оголене насіння), оскільки їх яйцеклітини та насіння не укладені в зав'язі або знайдені в захисних покривах плодів. Якщо на одному дереві хвойник має як пилок, так і насінні шишки, він далі класифікується як диплоїдний спорофіт. Як тільки насіння утворюються після запилення, луска конуса відкривається, щоб звільнити насіння для розпорошення водою, вітром та переміщенням людини та тварин.
