Збудники - це мікроби, які викликають захворювання у своїх господарів. Хоча рослинам зазвичай доводиться більше боятися ґрунтово-патогенних грибів, ніж ґрунтових бактеріальних захворювань, різноманітні патогенні бактерії, які мешкають у ґрунті, також викликають захворювання у рослин. Існує занадто багато видів збудників ґрунтових рослин, щоб перерахувати їх усі, але наведені нижче є одними з найбільш важливих або загальних. Кілька видів бактерій у ґрунті можуть виявитись небезпечними або навіть смертельними для людини.
Clostridium botulinum
C. ботулін - це грампозитивна бактерія (тобто бактерія, яка дає позитивні результати за тестом на фарбування за Грамом), яка утворює витривалі, міцні спори. Коли спори знаходять відповідні умови, вони проростають і починають рости. Вони можуть виробляти летальний білок, який називається ботулінічним токсином, який діє на нервову систему людини та інших ссавців, блокуючи вивільнення ключового нейромедіатора, званого ацетилхоліном. C. Спори ботуліну містяться в грунті та воді в багатьох регіонах світу. Вони анаеробні і ростуть лише за відсутності кисню; кислі умови пригнічують їх ріст. Хоча С. ботулін іноді спричиняє смертельні випадки харчової хвороби, яка називається ботулізм, потужний токсин, що виробляється бактерія також стала корисною для паралізації м'язової тканини у людини як частина різних медичних або косметичних засобів процедури. При використанні в якості терапевтичного засобу ботулотоксин відомий під торговою назвою - ботокс.
Erwinia carotovora
E. каротовора - це сильно руйнівний збудник, який викликає хвороби у широкого кола рослин, включаючи картоплю та більшість інших м’ясистих овочів. Ця грамнегативна паличкоподібна бактерія може вторгнутися в посіви в полі або під час зберігання. Підвид E. carotovora carotovora добре виживає в грунтових і поверхневих водах; він може рости в прикореневих зонах багатьох інших негрошових культур або навіть видів бур'янів, вражаючи картоплю чи інші вразливі культури, коли надає можливість. Поширені хвороби картоплі, спричинені Е. каротовора включає чорну ніжку, повітряну гниль стебла та м’яку гниль бульб.
Стрептоміцесна короста
Стрептоміцесова короста - це грампозитивні бактерії, які разом з двома іншими видами Streptomyces (S. acidiscabies та S. turgidiscabies) може заражати картоплю та інші коренеплоди, такі як буряк, редис, ріпа, морква та пастернак. Це незвично тим, що по мірі зростання клітини утворюють нитки, подібні до тих, що утворюються грибами - хоча і набагато меншими. Нитки S. Потім короста може обламатися, утворюючи спори. Бактерії поширюються, потрапляючи в молоді, свіжі тканини і потрапляючи в старі тканини через рани або природні отвори.
Ксантомонада
Ксантомонада - рід, що включає безліч важливих патогенів рослин. Хоча вони не дуже довго зберігаються в грунті, деякі види можуть вижити в ґрунті протягом зими та заразити новий урожай навесні. Як і всі інші протеобактерії, вони є грамнегативними. Вид X. campestris викликає чорну гниль у найрізноманітніших рослин і є, мабуть, найважливішим представником роду. Як не дивно, одна і та ж бактерія вирощується комерційно для отримання ксантанової камеді, звичайної харчової добавки.