Akış sitometrisi, hücreleri ve kromozomları incelemek için bir yöntemdir. Bu mikroskobik parçacıkların binlercesi her saniye analiz edilebilir. Bu, hücreler sıvı içinde tutulurken algılama aparatı ile yapılır. Teknik, kan kanserini incelemek ve teşhis etmek gibi birçok nedenden dolayı kullanılır. Bu yöntemin alternatifleri vardır, bu nedenle akış sitometrisinin avantaj ve dezavantajlarına bakmaya değer.
Heterojen hücre popülasyonlarını incelemek için akış sitometrisi kullanılıyorsa, alt popülasyonları birkaç dakika içinde analiz edecektir. Diğer seçeneklerden çok daha hızlı olmasının yanı sıra ürettiği veriler de detaylıdır. Analiz, yeşil hücrelere kıyasla kırmızı hücrelerin yüzdesini içerir ve parlak yeşil ve donuk yeşil hücreler hakkında bilgi sağlayarak daha da ileri gidebilir.
Tek tip hücre popülasyonlarına bakmak için akış sitometrisini kullanmak, her zaman tekdüze olmayanları vurgulama avantajına sahiptir. Ayrıca, nihai verileri sağlarken tüm kalıntıları veya ölü hücreleri de çıkarır. Bu doğruluk seviyesi, rekabeti geride bırakıyor.
Tek tip bir hücre popülasyonu incelenirken, istenen verilerin ortalama reseptör yoğunlukları olacağı yaygın bir durumdur. Akış sitometrisi bu işi kolaylıkla halledebilir, ancak radyoimmünoassay ve enzime bağlı immünosorbent tahlili gibi alternatiflerden daha pahalıdır. Sorun şu ki, bu alternatifler işi aynı hızla yapabilir ve hatta günde daha fazla numune üretebilir. Akış sitometrisi size ortalama yoğunluğu verir, ancak aynı zamanda böyle bir iş için ihtiyaç duymadığınız çok büyük miktarda bilgi verir.
Akış sitometri sıralayıcıları çok hassastır ve küçük veya karmaşık alt popülasyonları saflaştırır. Ancak yüksek hızlı bir sıralayıcı bile bazen istenen sonuçları elde etmek için yeterince hızlı olmayabilir. Örneğin, bir çift hücre genellikle atılır çünkü sıralayıcı bunları zamanında ayırt edemez. Yüksek hızlı bir sıralayıcı, tüm popülasyonun yüzde 20'sini oluşturan bir alt popülasyonla uğraşırken saatte 106'ya kadar hücre üretebilir. Bu oran birçok deney için çok düşüktür.