Çift sarmallı DNA'nın yapısı tüm canlı hücrelerde evrenseldir, ancak hayvan ve bitki hücrelerinden genomik DNA'yı çıkarma yöntemlerinde farklılıklar meydana gelir. Genomik DNA hücre çekirdeğinde yaşasa da, ekstrakte edilen DNA'nın miktarı ve saflığı hücrenin tipine ve boyutuna bağlıdır. Örneğin, bazı hücreler diğerlerinden daha fazla DNA ve safsızlık içerir. DNA ekstraksiyon farklılıkları hakkında daha fazla bilgi edinmek için okumaya devam edin.
Genel DNA Ekstraksiyonu
Bitki ve hayvan hücrelerine sabunlu bir madde uygularsanız, hücre ve nükleer zarlardaki lipidleri bozar. Daha sonra DNA karışımı hücre zarlarından ve proteinlerden ayrılacaktır. Ardından, çözeltideki DNA'yı çökeltmek için alkol kullanabilirsiniz. Numunedeki miktara bağlı olarak DNA çıplak gözle görülebilir. Ancak, bu basit prosedürün mutlaka yüksek saflıkta DNA üretmediğini unutmayın.
Bitki ve Hayvan Hücreleri
Bitki hücreleri, sert hücre duvarları ve kloroplast gibi organelleri nedeniyle hayvan hücrelerinden farklıdır. Ayrıca fotosentezde rol oynayan proteinler ve enzimler içerirler. Bazı bitki hücrelerinde poliploidi vardır, yani hücre başına her kromozomun birden fazla kopyasına sahiptirler. Ek olarak, fotosentez gibi bitkilerde meydana gelen hücresel süreçler, bir dizi ikincil metabolit üretir. Hayvan hücrelerinin hücre duvarı yoktur, ancak yine de genomik DNA'yı serbest bırakmak için hücre zarını parçalamak için sodyum dodesil sülfat (SDS) gibi kimyasallara ihtiyaç duyarlar.
Bitki DNA Ekstraksiyonu
Bitki genomik DNA'sının, bitkinin hücre duvarı nedeniyle çıkarılması daha zordur. Hücre duvarını oluşturan selülozu parçalamak için homojenize ederek veya selülaz ekleyerek uzaklaştırabilirsiniz. Ek olarak, bitki hücresinde bulunan metabolitler, çökeltme işlemi sırasında DNA örneğini kontamine ederek genomik DNA ekstraksiyonuna müdahale edebilir.
Hayvan DNA'sı Ekstraksiyonu
Periferik kan lökositleri, hayvan genomik DNA'sının ana kaynağıdır, ancak kanın doğrudan hayvandan gelmesi gerektiğinden numune toplanması zordur. Kan, DNA örneğini kontamine edebilen proteinler, lipidler, beyaz kan hücreleri, kırmızı kan hücreleri, trombositler ve plazma gibi bir dizi bileşik içerir. Bununla birlikte, kan örneklerinden ekstrakte edilen hayvan DNA'sının birincil kirleticisi, hemoglobinin protein olmayan bileşeni olan hem'dir.
DNA Farklılıkları
Bitki ve hayvan DNA'sı arasındaki farklar, sarmaldaki baz dizisinde yatmaktadır. Bitki hücrelerinde bulunan bileşikler hayvan hücrelerinde bulunmaz ve DNA baz dizileri bunu yansıtır. Ayrıca genomik bitki DNA'sı genellikle hayvan DNA'sından daha büyüktür. Bu farklılıklar DNA'nın ekstraksiyon yöntemlerini, verimini ve saflığını da etkiler.