Bilim adamları, DNA molekülünü dizileme yeteneğine sahiptir; başka bir deyişle, herhangi bir moleküldeki nükleotid bazlarının sırasını belirleyebilirler. DNA molekülünün dizilenmesi, spesifik molekülün nasıl olduğunu anlamak için gereken bir dizi adımın ilki olabilir. Bir DNA molekülündeki nükleotidler birbirleriyle etkileşime girer ve farklı özellikleri kodlar. organizma. DNA dizileme süreci oldukça ilgili, ancak otomatik DNA dizileyiciler, sürecin en azından bir kısmı için gereken insan müdahalesini en aza indiriyor.
Örnek hazırlama
Otomatik bir DNA sıralayıcının çalışması için DNA'yı oluşturan dört nükleotid bazını algılaması gerekir: adenin, guanin, timin ve sitozin. Bilim adamları bir DNA parçasını birçok kez kopyalarlar ve DNA'yı farklı boyutlardaki parçalara kesmek için kısıtlama enzimleri kullanırlar. Daha sonra her bir DNA grubuna az miktarda floresan etiketli baz eklerler. Adenin, timin, guanin veya sitozin olan baz, bir ipliğin sonunda baz tamamlayıcısına bağlanacaktır. Örneğin, adenin, timin ile biten zincirlere bağlanır ve guanin, sitozin ile biten zincirlere bağlanır.
Otomatik DNA Sıralayıcı Yapısı
Otomatik bir DNA sıralayıcı, daha fazla el emeği gerektiren bir DNA sıralayıcıya çok benzer şekilde yapılmıştır. Spesifik olarak, bir otomatik DNA sıralayıcı, içine DNA'nın dökülebileceği 96 jel kuyusu olan yaklaşık 1 fit uzunluğunda bir tanktır. Otomatik DNA sıralayıcıda, herhangi bir DNA sıralayıcıda olduğu gibi, DNA, tankın üstündeki jel kuyularına enjekte edilir ve tankın o ucuna negatif bir yük uygulanır. Negatif yük, DNA zincirlerinin tankın sonuna kadar farklı mesafeler kat etmesi için güçlü bir itici güç sağlar.
Otomatik Enjeksiyon
Otomatik bir DNA sıralayıcı, jelin üst kısmına otomatik olarak DNA yığınları enjekte eder. Bu nedenle, araştırmacılara muazzam miktarda zaman ve çaba tasarrufu sağlar. Partiler enjekte edildikten sonra, sıralayıcı otomatik olarak tankın bir ucuna negatif bir yük uygulayarak ipliklerin jel boyunca değişen mesafelerde hareket etmesine neden olur. Farklı mesafeler, jelden geçen farklı boyutlardaki DNA ipliklerini yansıtır.
dedektör
Jelden geçen DNA iplikleri üzerindeki floresan boyayı tespit etmek için birçok otomatik DNA dizileme makinesi kurulmuştur. Bunu yaparken ipliklerin uçlarında bulunan nükleotidleri tespit edip bilgisayara kaydedebilirler. Bununla birlikte, sıralayıcılar, en iyi ihtimalle, DNA nükleotidlerinin karışık bir versiyonunu sunarlar. Otomatik bir DNA dizileme makinesi kullandıktan sonra, bilgisayarların bir araya geldiği "bitirme" adı verilen bir süreçten geçmelisiniz. ve araştırmacılar, verileri bir DNA'nın kapsamlı bir tanımında birleştirmek için tespit edilen DNA zincirinden elde edilen sonuçları sıralar. iplik. Şaşırtıcı olmayan bir şekilde, bu süreç, gerçek sıralama sürecinden çok daha uzun sürebilir.