Bitkiler, algler ve çeşitli fitoplanktonların hücrelerinde klorofil bulunur. Hücrelerin moleküler bileşiminin bu hayati kısmı, organizma veya bitki içindeki fotosentez sürecini kontrol eder. Araştırmacılar genellikle göllerden, nehirlerden ve akarsulardan alınan yüzey suyu örneklerinde ve ayrıca bitki yaşamında klorofil seviyelerini test eder. Test sonuçları, numuneyi etkileyen mevcut koşulları ve besin seviyelerini gösterir.
Klorofil seviyelerini ölçmek, bir organizmanın durumunu ve su kalitesini belirlemeye yardımcı olur. Yüksek klorofil seviyeleri genellikle numunenin besin maddelerinde, genellikle azot ve fosforda yüksek olduğunu gösterir. Anormal derecede düşük klorofil seviyeleri, bölgedeki olası kirliliği, septik sistem sızıntısını veya akıntıyı gösterir. Genellikle numune alanındaki değişiklikleri izlemek için numuneler toplanır ve zaman içinde karşılaştırılır.
Spektrofotometri ve yüksek performanslı sıvı kromatografisi (HPLC), bir su numunesindeki klorofil miktarını ölçmek için kullanılan iki yöntemdir. Su toplanır ve klorofil içeren organizmaları izole etmek için süzülür. Bu organizmaların hücreleri, klorofili çıkarmak için parçalanır. Toplanan numune bir aseton çözeltisine yerleştirilir. Numune, ya spektrofotometri ya da HPLC yöntemi ile analiz edilir. Spektrofotometri, klorofilin emiciliğine veya floresan özelliklerine bakmayı içerir. Numune, HPLC yöntemiyle de analiz edilebilir. İki laboratuvar test yöntemi, örneğin floresan özelliklerini ölçüyor. Numuneler, klorofilin daha yüksek bir dalga boyu yayarak reaksiyona girmesini sağlayan belirli bir dalga boyuna (genellikle 663 ve 645 nm) maruz bırakılır.
Genellikle canlı bitkilerin klorofil seviyelerini test etmek için bir metre kullanabilirsiniz. Büyük olasılıkla bir bitki yaprağı olan numunenin yüzeyinde iki LED ışık parlıyor. Kırmızı LED ışığı, 650 nm'lik bir tepe dalga boyuna ve 940 nm'lik bir tepe noktasında kızılötesi LED'e sahiptir. Işığın bir kısmı klorofil tarafından emilir; geri kalanı numune boyunca emilir. Klorofilin numunenin diğer ölçümlerine oranı sayaç içinde hesaplanır ve 0 ile 199 arasında isteğe bağlı bir birim olarak görüntülenir.