Transmisyon elektron mikroskobu (TEM) ve taramalı elektron mikroskobu (SEM), son derece küçük numuneleri görüntülemek için kullanılan mikroskobik yöntemlerdir. TEM ve SEM, her teknolojinin numune hazırlama yöntemleri ve uygulamalarında karşılaştırılabilir.
Her iki elektron mikroskobu türü de numuneyi elektronlarla bombardıman eder. TEM, nesnelerin içini incelemek için uygundur. Boyama kontrast sağlar ve kesme, inceleme için ultra ince numuneler sağlar. TEM, virüslerin, hücrelerin ve dokuların incelenmesi için çok uygundur.
SEM tarafından incelenen numuneler, görüntüyü karartacak fazla elektronları toplamak için altın-paladyum, karbon veya platin gibi iletken bir kaplama gerektirir. SEM, makromoleküler agregalar ve dokular gibi nesnelerin yüzeyini görüntülemek için çok uygundur.
Bir elektron tabancası, bir yoğunlaştırıcı mercek tarafından odaklanan bir elektron akışı üretir. Yoğunlaştırılmış ışın ve iletilen elektronlar, bir objektif mercek tarafından fosfor görüntü ekranındaki bir görüntüye odaklanır. Görüntünün daha koyu alanları, daha az elektronun iletildiğini ve bu alanların daha kalın olduğunu gösterir.
TEM'de olduğu gibi, bir elektron ışını bir mercek tarafından üretilir ve yoğunlaştırılır. Bu, SEM'de bir seyir merceğidir. İkinci bir mercek, elektronları sıkı, ince bir ışına dönüştürür. Bir dizi bobin, ışını televizyona benzer şekilde tarar. Üçüncü bir mercek, ışını numunenin istenen bölümüne yönlendirir. Kiriş belirli bir nokta üzerinde durabilir. Işın, numunenin tamamını saniyede 30 kez tarayabilir.