Biyoçeşitliliği ile tanınan Malezya, 15.000 çiçekli bitkiye ev sahipliği yapmaktadır. Bununla birlikte, ülkenin florası ve faunası ciddi tehdit altında ve orijinal büyümede yüzde 70'lik bir azalma yaşadı. Uluslararası Doğayı Koruma Birliği'nin (IUCN) Kırmızı Listesine göre, Malezya'da 2007 yılı itibariyle 686 nesli tükenmekte olan bitki türü bulunmaktadır. Malezya yasaları kuşları, memelileri ve böcekleri korur. Flora ve fauna, yalnızca bir milli park veya rezerv içinde büyüyorlarsa korunur.
Malezya'daki ana orman türleri, Worldwide Wildlife Fund'a göre Giam Kanching veya nadir dipterocarp ormanı, mangrov ormanı, turba bataklığı ormanı ve dağ erik ormanıdır. İki kanatlı tohumlu meyvesi ile tanınan dipterocarp ağacı, deniz seviyesinin hemen üzerinde, yaklaşık 900 metre yükseklikteki karalarda yetişiyor. Deniz seviyesinden 300 metre yüksekliğe kadar bulunan ova dipterocarp ormanları, tarım ve diğer arazi yoğun faaliyetler nedeniyle yok olmuştur. Kanching Orman Rezervi'nde bir dipterocarp ağacı cebi korunurken, bu türün Kırmızı Liste'de kritik derecede tehlikede - yok olma eşiğinde - olduğu kabul edilir.
Bu etobur tropik bitki, Borneo'daki Trus Madi Dağı'ndaki 2.000 ila 2.600 metre yükseklikte yalnızca yosunlu ormanlarda yetişir. Nepenthes macrophylla, on metre uzunluğundaki asmalardan sarkan testi şeklinde yapraklara sahiptir. ASEAN Biyoçeşitlilik ve Çevre Koruma İncelemesine göre, böcekler çiçeğin mumsu tepesinden çiçeğin alt kısmındaki bezler tarafından salgılanan bir asit havuzuna kayar. IUCN'nin Kırmızı Listesi, Nepenthes macrophylla'yı kritik tehlike altında olarak sınıflandırmıştır.
Kırmızı Listede kritik olarak tehlikede olduğu düşünülen Taxitheliella richardsii, Sematophyllaceae familyasında bir yosundur ve Malezya'ya özgüdür. Yosun bulunduğu bilinen tek alan (10 km²'den az), kuzeybatı Borneo'da bir Malezya eyaleti olan Sarawak'ta. Taxitheliella richardsii, odun hasadı ve ağaç kesimi nedeniyle yok olan bir habitat olan subtropikal ormanlarda odunsu asmalar ve çürümüş kütüklerde yetişir.