Bakterier är små encelliga organismer som är både fördelaktiga och skadliga för människor. Vissa former av bakterier hjälper oss att leva, till exempel de som hjälper till att bryta ner maten i våra tarmar. Andra former, såsom bakterier som orsakar bubonisk pest, kan döda en person om den lämnas obehandlad. Det finns många olika typer av bakterier och de andas med olika metoder. De två primära metoderna för bakteriell andning är aerob andning och anaerob andning.
Aerobiskt andningsaktiva former av bakterier kräver syre för att leva. De använder syre som bränsle för att hjälpa till att bränna energi och förse dem med den energi som behövs för livet. Denna typ av bakteriell andning är av samma typ som människor använder, därav termen "aerob träning." Den största biprodukten av aerob andning från bakterier är koldioxid.
Många typer av bakterier andas anaerobt. Med andra ord kan de gå igenom andningsprocessen utan syre. Istället för att använda syre för att hjälpa dem att bränna energin i maten använder dessa typer av bakterier andra naturligt förekommande kemikalier för att skapa kemiska reaktioner och frigöra den energi de behöver. Vanliga naturligt förekommande kemikalier som används inkluderar nitrater, sulfater och koldioxid. Anaerob andning hos bakterier skapar i allmänhet många biprodukter. Många av dessa biprodukter kan vara giftiga eller farliga för människor och inkluderar etanol och väte.