Strukturen för deoxiribonukleinsyra - DNA - visade sig vara en dubbelspiral för flera år sedan, men konventionen att namnge varje sträng har blivit ett förvirringsämne för både forskare och studenter. Bland DNA-par heter det ena Watson och det andra Crick, efter de två medupptäckarna av DNA. Men den vetenskapliga litteraturen håller inte med om vilken del som ska ges vilket namn. Watson-Crick-namngivningssystemet var tänkt att indikera de distinkta funktionella egenskaperna för varje sträng i DNA-strukturen, vilket är samma mål för de andra namngivningssystemen. Det är viktigt att förstå de olika sammanhang där de enskilda delarna behöver ta olika namn. Två perfekta exempel är deras olika roller i DNA-replikering eller transkription. Att veta vad varje sträng gör i en biologisk process kommer att hjälpa till att klargöra varför den fick det namnet.
Anti-Sense är inte nonsens
Transkription är processen för att kopiera DNA till RNA. Det görs av ett enzym som kallas RNA-polymeras (RNA Pol). RNA Pol läser bara en av de två DNA-strängarna eftersom den gör RNA-molekylen. Den dubbelsträngade DNA-molekylen delas isär och RNA Pol binder till en sträng som den kommer att läsa och kopiera. Denna tråd kallas mallsträngen eller antisenssträngen. RNA-molekylen som produceras kommer att vara komplementär till mallsträngen, vilket betyder nukleotiderna i mallsträng och RNA-molekyl matchar med varandra enligt reglerna: adenin till uracil och guanin till cytosin.
Den här gör mening
När RNA transkriberas från DNA binds RNA-polymeras till och kopierar mallsträngen. Den återstående strängen kallas den kodande strängen (se referens 5), eller senssträngen. Med tanke på basparningsreglerna för nukleinsyror (A-par med T och G-par med C) har kodningen, eller sense, DNA-strängen en identisk sekvens som den för RNA som produceras. Undantaget här är att RNA innehåller nukleotiden U (uracil) istället för T (tymin), som båda parar med A (adenin).
Smooth Ride
Innan mitos eller celldelning måste cellen replikera sitt DNA så att varje dottercell har identiskt antal DNA-strängar. DNA-polymeras är det enzym som kopierar långa sträckor av DNA till mer DNA. Vid replikationsgaffeln packas DNA-molekylen upp för att bilda en bubbla i vilken polymeras glider. Polymeras binder till båda strängarna i det oupprullade DNA: t och börjar göra kopior av båda strängarna. En av kopiorna är gjorda som en enda kontinuerlig sträng, som kallas den ledande strängen. DNA-replikering är ett annat fall där DNA-strängarna har olika namn.
Stop And Go Traffic
Den anti-parallella strukturen på DNA-stegen innebär att en sträng går från topp till svans medan den andra strängen går från svans till huvud. Under DNA-replikering måste DNA-polymeras läsa och kopiera båda trådarna samtidigt, även om de löper i motsatta riktningar. Eftersom DNA-polymeras bara kan läsa och kopiera DNA-strängar i en riktning - svans mot huvud - strängen att Polymerase-möten som orienterade i huvud-till-svans inte kan läsas och kopieras som en kontinuerlig strå. Denna huvud-till-svans-sträng kopieras som korta fragment, kallade Okazaki-fragment, som senare smälts samman till en lång sträng. I DNA-replikering kallas strängen som bildas i fragment den släpande strängen.