En allel är en möjlig kodande sekvens av en gen. En vanlig missuppfattning eller felaktig terminologi är att det finns gener för specifika egenskaper. Gener styr olika egenskaper hos en organism, såsom hårfärg eller ögonfärg, men det faktiska uttrycket av ett drag beror på vilken allel som är dominerande. Till exempel kan genen för ögonfärg hos människor ha en allel för bruna ögon och en allel för blå ögon, eller en allel för bruna ögon och en för gröna ögon. Människor, liksom andra livsformer som har två kopior av varje kromosom, har också två kopior av varje gen för att lagra alleler.
De två kopiorna av en gen, en på var och en av kromosomerna, innehåller vardera en allel. Homozygositet uppstår när de två genkopiorna innehåller samma allel för en viss fenotyp eller uttryckt drag. Heterozygositet uppstår när de två allelerna är olika. Fenotyper kan antingen vara dominerande eller recessiva. Om en fenotyp är dominerande behöver bara en av allelerna för den finnas. Om det är recessivt måste båda allelerna vara närvarande.
Enligt Utah State Office of Education kan ett Punnett-torg användas för att förutsäga sannolikheten att en viss genotyp kommer att förekomma hos avkomma genom att ta de två föräldrarnas alleler och kombinera dem. Genotypen kommer att påverka fenotypen, beroende på om allelerna är dominerande eller recessiva. Den grundläggande Punnett-torget är uppdelad i fyra mindre rutor. De ena föräldrarnas möjliga gener listas ovanför de två översta rutorna, den andra bredvid den går lodrätt ner till vänster. Stora bokstäver betecknar dominerande alleler och små bokstäver betecknar recessiva alleler. Till exempel skulle en homozygot dominerande gen för bruna ögon skrivas som BB och en heterozygot som Bb. En homozygot recessiv gen skulle skrivas som bb. Genom att ta bokstäverna intill varje kvadrat, för ett Bb x Bb-kors, skulle sannolikheten för en BB-genotyp vara 25 procent, Bb 50 procent och bb 25 procent. När det gäller fenotyp har avkomman 75 procent chans att ha bruna ögon eftersom bruna ögon är en dominerande fenotyp, enligt sciencekidsathome.com.