Malaysia är känt för sin biologiska mångfald och har 15 000 blommande växter. Men landets flora och fauna är under allvarligt hot och har upplevt en uttömning på 70 procent av den ursprungliga tillväxten. Enligt International Union for Conservation of Nature (IUCN) röda lista har Malaysia 686 hotade växtarter från och med 2007. Malaysiska lagar skyddar fåglar, däggdjur och insekter. Flora och fauna skyddas endast om de växer inom en nationalpark eller reservat.
De viktigaste skogstyperna i Malaysia är Giam Kanching eller sällsynt dipterocarpskog, mangroveskog, torvträdskog och bergskog, enligt Worldwide Wildlife Fund. Dipterokarpträdet, känt för sin frukt med tvåvingade frön, växer på land som ligger strax över havsnivån till en höjd av cirka 900 meter. Låglands dipterokarpskogar, som finns upp till 300 meter över havet, har decimerats på grund av jordbruk och andra markintensiva aktiviteter. Medan en ficka med dipterokarpträd är skyddad i Kanching Forest Reserve, anses denna art vara kritiskt hotad - på gränsen till utrotning - på den röda listan.
Denna köttätande tropiska växt växer endast i mossiga skogar på 2000 till 2600 meters höjd på Mount Trus Madi i Borneo. Nepenthes macrophylla har krukformade löv som dinglar från tio meter långa vinstockar. Insekter glider från den vaxartade toppen av blomman in i en syrabassäng som utsöndras av körtlar i den nedre delen av blomman, enligt ASEAN Review of Biodiversity & Environmental Conservation. IUCN: s röda lista har kategoriserat Nepenthes macrophylla som kritiskt hotad.
Taxitheliella richardsii anses vara kritiskt hotad på rödlistan och är en mossa i familjen Sematophyllaceae och hemma i Malaysia. Det enda kända området (mindre än 10 km²) där mossan har hittats är i Sarawak, en malaysisk stat i nordvästra Borneo. Taxitheliella richardsii växer på träiga vinstockar och ruttna stockar i subtropiska skogar, en livsmiljö som försvinner på grund av träskörd och avverkning.
