En centrifug är en apparat som består av ett fack som snurrar på en central axel. Den snurrande rörelsen får material att separera baserat på deras olika tyngdkraft. En centrifugrotor är centrifugens roterande enhet som har fasta hål borrade i en vinkel. Provrör placeras inuti dessa hål och rotorn snurrar för att underlätta separeringen av materialen. Det finns tre typer av centrifugrotorer: svängskopa, fastvinklade och vertikala rotorer.
En sväng-skoprotor stöder vanligtvis prover som sträcker sig i volym från 36 ml till 2,2 ml. Swing-hinkar kan stödja två typer av separationer: rate-zonal och isopycnic. Swing-hinkar är att föredra för separationshastighet i zon, eftersom avståndet mellan utsidan av menisken och utsidan av rörets botten är tillräckligt lång för att separering ska kunna ske.
Rotorer med fast vinkel används vanligtvis för pelleteringsapplikationer på antingen pelletspartiklar från en suspension och avlägsnar överflödigt skräp eller för att samla upp pelleten. Rotorhåligheter varierar från 0,2 ml till 1 ml. Den viktigaste aspekten för att välja en rotor med fast vinkel är K-faktorn. K-faktorn indikerar hur effektiv rotorn kan pelletera vid maximal hastighet. Ju lägre K-faktor, desto högre pelleteringseffektivitet.
Vertikala rotorer är mycket specialiserade. De används vanligtvis för att banda DNA i cesiumklorid. Vertikala rotorer har mycket låga K-faktorer, vilket är användbart om partikeln bara måste röra sig en kort sträcka tills den pelletsar. Körtiden på vertikala rotorer är kort.