Микроскопи су коришћени у много различитих поља за посматрање ситних примерака. Постоје разне врсте микроскопа, сваки са својим методама за преглед различитих аспеката датог узорка. Већина микроскопа има сет објектива и сочива окулара који омогућавају да се види увећана слика. Многим микроскопима се такође може додати камера за снимање слика ради касније анализе. Наставни микроскопи обично имају два комплета окулара, тако да друга особа може видети исту слику као и особа која управља апаратом.
Једињење
Најјефтинији и најчешћи микроскоп који се користи у лабораторијама је сложени микроскоп. Ови микроскопи користе сочива различитих јачина за увећавање предмета. Сложени микроскопи обично имају окулар, сет огледала и сочиво објектива који раде заједно. Слике се виде у две димензије. Уз помоћ додатка камере за микроскоп, посматрач може касније сачувати слике за анализу.
Скенирајући електронски микроскоп
Електронски микроскоп за скенирање може да посматра објекте са 3-Д сликом. Слике имају велико увећање и високу резолуцију, али се појављују црно-беле. Да би се направиле детаљне слике, примерак је пресвучен честицама злата. Електрони се одбијају од златне облоге да би створили слику. Ова врста микроскопа је корисна за прецизно гледање врло ситних предмета, а слике се чувају за касније гледање. Уобичајени објекти који се гледају су детаљне слике бактерија, вируса и неких ћелијских компоненти.
Трансмисиони електронски микроскоп
Ова врста микроскопа користи електроне за пролазак кроз узорак. Дводимензионалне слике настају стварањем танких кришки високе резолуције и великог увећања. Трансмисиони електронски микроскопи су корисни за добијање слика кроз дебљину узорка, а не само површину. Будући да су скупи, већа је вероватноћа да ће се ови микроскопи наћи у великим истраживачким објектима и на универзитетима.
Стереоскоп
Стереоскопи се могу користити за преглед објеката у три димензије. Увећање није толико јако као код других врста микроскопа, али вам омогућава да видите детаље који се иначе не би могли видети голим оком. Они се називају и „дисекционим“ микроскопима, јер се обично користе као помоћ у дисекцији малих примерака.
Флуоресцентни микроскоп
Микроскопи се могу користити за преглед различитих аспеката узорка променом начина на који се слика ствара. Флуоресцентни микроскопи користе специфичне боје светлости за интеракцију са бојама. Како се боје освјетљавају, одређене структуре могу бити изоловане и посматране одговарајућим бојама. Ова врста микроскопа је корисна за посматрање специфичних протеина у ћелији. Обично је причвршћена камера за снимање слика са микроскопа.