Архебактерије су организми који се заправо биохемијски и генетски веома разликују од осталих бактерија. Стога су архебактерије застарели појам и сада су класификоване у домену Археје. Класификације у овом домену су незваничне због расправа о потомству микроба. Многи живе на екстремним температурама хидротермалних отвора дубоко у океану или у врелима, а неки живе у блату без кисеоника. Други живе у врло сланој води, а трећи у екстремним алкалним или киселим срединама, или чак у уљу. Следећи примери су класификовани према таксономском поретку краљевства, рода, класе, реда, породице, рода и врсте.
Хидротермална вентилациона археја
Један пример у домену Археје је Метаноцалдоцоццус јаннасцхии, тренутно класификовано као Арцхаеа: Еуриарцхаеота: Метанобактерије; Метанобактерије: Метанобактерије, Метанокалдокок и врсте јаннасцхии. Добијен је из хидротермалног отвора на дну океана који живи под притиском већим од 200 атмосфера и температурама изнад 85 степени Целзијуса. Опстаје без кисеоника и производи метан као производ свог метаболизма.
Археје успевају у људском цреву
Метанибревибацтер смитхии тренутно се класификује као Арцхаеа; Еуриарцхаеота; Метанобактерије; Метанобактерије; Метанобактерије; Метанобревибацтер и врсте смитхии. Заузима људска црева и функционише без кисеоника. Претвара ЦО2 на метан и важан је у разградњи хранљивих састојака.
Археја која воли сол
Халокуадра валсбии тренутно је класификована као Арцхаеа; Еуриарцхаеота; Халобактерије; Халобацтериалес; Халобацтериацеае; Халокуадратум; и врста валсбии. Пребива у изузетно сланом окружењу и користи енергију сунца у процесу фотосинтезе. Они су квадратног облика и имају вреће напуњене гасом које им омогућавају да плутају. Такође се могу повезати и формирати велике листове.
Дубокоморске археје које користе сумпор
Тхермоцоццус литоралис је још једна врста дубоког морског вентилационог вентила. Тренутно је класификован као Археја; Еуриарцхаеота; Термококи; Тхермоцоццацае; Тхермоцоццус; и врста литоралис. За раст му је потребан сумпор и, за разлику од осталих примера, не производи метан. Успева на високим температурама и једна је од археја, укључујући још увек откривене врсте.
Мала, паразитска археја стоји самостално у класификацији
Наноарцхаеум екуитанс је једини познати члан подкласе Наноарцхаеота Арцхаеа. Научници су открили да живи на ћелијским зидовима нове Игницоццус врсте пронађене на дну океана, у близини термалних вентилационих отвора и у врелу смештеном у националном парку Јелоустон. Наноарцхаеум екуитанс, који изгледа да има паразитски однос са Игницоццус врста, мала је, пречника само 400 нанометара, и чини се да успева на температурама између 167 и 204 степени Фахренхеита.