Унутар животног циклуса биљног семена, семе борави у стању мировања пре фазе клијања. Током периода мировања долази до мало активности јер семе чека да почну прави услови околине за раст. Једном када клијање започне, стопе ћелијског дисања драстично се повећавају како би се обезбедили потребни материјали за почетне фазе раста биљака.
Процеси ћелијског дисања пружају ћелијама средство да претворе постојеће хранљиве материје у енергију. Током периода мировања, семе биљака одмара таман толико да одржи храну или залихе хранљивих састојака у специјализованом слоју семена познатом као ендосперм. Унутар цветних биљака, ендоспермне структуре су производ двоструког процеса оплодње који се одвија када се биљна јајница или јајник први пут оплоди. У ствари, ендосперм обезбеђује потребе семена за хранљивим састојцима и обавља неопходне функције ћелијског дисања током целог периода мировања. Почетак клијања поставља значајне енергетске потребе на семе како се процеси раста биљака обликују. Као резултат, брзине ћелијског дисања се повећавају како би се прилагодиле активностима изградње ћелија потребних за отварање семена и стварање почетних структура корена и стабљике.
Семе биљака потиче од цвећа, воћа, зелених биљака и дрвећа које расте у безброј услова околине. Није изненађујуће што свака врста семена тражи одређене покретаче из околине који подстичу почетак процеса клијања. Према Универзитету Цорнелл, покретачи из околине могу се појавити као повећани нивои хранљивих састојака у тла, промене температуре тла, повећане количине падавина или повећање количине и квалитета светло. Када се испуне потребни услови, семе почиње да повећава стопу упијања воде, што означава почетак клијања. Повећана апсорпција воде омогућава семену да мобилише резерве хране ускладиштене у слојевима ендосперма. Ови процеси активирају одређене ензиме који покрећу повећање ћелијске стопе респирације семена.
Клијаво семе врши процесе ћелијског дисања на сличан начин као што то раде биљне и животињске ћелије. Ћелијско дисање одвија се у три фазе, почевши од гликолизе. Фаза гликолизе користи молекуле глукозе за производњу две јединице енергије или молекула АТП (аденозин трифосфат) заједно са другим хемијским материјалима. Кребсов циклус чини другу фазу ћелијског дисања. У овој фази производи од гликолизе производе се за још две енергетске јединице и трансформишу хемикалије преостале од гликолизе у молекуле који преносе водоник. Ланац преноса електрона је трећа фаза у процесу дисања, а напајају је два АТП молекула произведена у Кребсовом циклусу. Ова фаза комбинује енергију која се налази у молекулима водоника из Кребсовог циклуса са кисеоником да би се створило 38 молекула АТП. Овај тростепени процес се понавља изнова у свакој појединачној биљној ћелији. Молекули АТП произведени ћелијским дисањем пружају енергију за започињање клијања и подстичу активности изградње ћелија које на крају формирају биљно тело.