ДНК садржи кодирана упутства која ћелијама требају да раде. У еукариоту, организму са језгром у свакој од ћелија, ДНК се чува унутар језгра, па они упутства се морају пренети у ћелију тако што ће се прво направити њихова копија у полимеру који се назива мессенгер РНА или мРНК. мРНА се уређује ћелијским машинама пре него што напусти језгро и додаје му се неколико важних молекуларних карактеристика да би се означило као готова и спремна за употребу.
Ограничавање мРНК
Прва хемијска модификација коју деле све еукариотске мРНК назива се 5 'капа. Ензим РНК полимераза путује дуж ланца ДНК правећи РНК копију или транскрипт. Крај РНК полимера где је РНК полимераза почела да синтетише назива се 5 'крај. Три друга ензима додају хемијску групу која се назива 7-метилгванилат на 5 'крају; ова модификација се назива капа. Ако се мРНК појави у ћелији без поклопца од 5 ', могу је разбити други ензими; упутства која садржи никада неће бити преведена. Капа од 5 'означава мРНК као легитимну и штити је од пропадања.
Полиаденилација
Друга универзална модификација пронађена само у еукариотској мРНК је поли-А реп. 5 'крај мРНК је место где је започела РНК полимераза, а 3' реп је место где се завршава. Након транскрипције, ензим назван поли (А) полимераза додаје негде од 100 до 250 додатних аденозин или А подјединица, па отуда и назив поли А реп. Чини се да овај реп чини мРНК стабилнијом и означава је као предодређену за извоз из језгра.
Функције за модификације
5 'капице и поли-А репови налазе се у свим еукариотским мРНК. Међутим, бактерије и други прокариоти такође користе мРНК, али њиховим мРНК недостају ове две карактеристике. Еукариотска мРНК се понекад уређује или спаја пре него што напусти језгро, тако да треба да регулишу које мРНК могу да напусте језгро. Штавише, превод упутстава кодираних у мРНК је много строже регулисани процес код еукариота, а ове модификације такође играју важну улогу у том процесу. За разлику од еукариота, прокарионти немају језгро, тако да нема потребе за регулисањем уласка или изласка мРНК - чим се мРНА транскрибује, она се ослобађа у ћелији.
Вируси и мРНК
Када вирус зарази еукариотску ћелију, патоген треба да осигура да ћелија домаћин престане да производи сопствене протеине и уместо тога почне да производи вирусне протеине и РНК. Неки од њих попут полиовируса и пикорнавируса носе ензим који уситњава протеин потребан за превођење упутстава ускладиштених у 5'-затвореном мРНК. Као резултат, ниједна мРНК ћелије се не преводи, а вирусна РНК која није ограничена се преводи. Тиме преузимају оно што би могло представљати одговорност - њихов властити недостатак 5'-капице - и претварају је у предност.