Започните процес идентификације непознатих бактерија посматрајући њихове физичке карактеристике, попут ћелијског зида, облика и веза. Користите стандардне лабораторијске поступке, попут бојења ћелија, узгоја и секвенцирања ДНК да бисте додатно сузили вашу идентификацију. Бактерије се обично групишу у врсте према њиховим физичким и метаболичким карактеристикама, а не према генетском односу једни с другима.
Позитивно или негативно
Еубактерије су такозване праве бактерије. Они се разликују од археја или архебактерија, које чине засебно царство. Еубактерије су прокариоти, што значи да им недостаје нуклеарна мембрана. Већина има ћелијске мембране и ћелијске зидове. Бактерије са дебелим ћелијским зидовима називају се грам-позитивним, јер су подложне умирању током теста названог Грамова мрља. Боја по Граму је први тест који се користи у класификацији бактерија. Бактерије са танким или одсутним зидовима ћелија су грам-негативне, јер не задржавају боју по Граму.
Обликовање бактерија
Сферне бактерије називају се коки, бактерије које формирају равне шипке називају се бацили, а бактерије средњег облика кокобацили. Сви они могу бити грам-негативни или грам-позитивни. Круте бактерије спиралног облика познате су под називом спирилла и само су грам-негативне. Флексибилне, независно покретне, бактерије у облику спирале називају се спирохете и грам су неутралне. Коначно, круте шипке у облику зареза називају се вибриони и грам-негативне. Неколико мало познатих и слабо разумених бактерија има различите облике, попут звезде у облику звезде и лабрија у облику секире. Постоје и две средње бактеријске групе. Рикеције су сличне вирусима, имају разне облике, грам-негативне су и могу преживети само унутар других ћелија. Микоплазме, које су сличне гљивицама, немају ћелијске зидове и укључују многе плућне патогене који узрокују упалу плућа.
Коцке, кластери и друге везе
Цоцци и бацили су даље класификовани према везама које настају након деобе ћелија. Диплококи и диплобацили се држе у паровима. Стрептококи и стрептобацили чине ланце. Тетрад коки остају на квадратима од четири бактерије. Коки Сарцинае формирају коцке од осам бактерија, а стафилококи гроздове.
Идентификовање бактерија
Ако имате непознату бактерију и желите да је идентификујете, обично ћете направити мрљу од грама, а затим посматрати изглед колоније и појединачне карактеристике. У том тренутку можете рећи да имате, на пример, грам негативне аеробне стрептобациле. Затим можете да упоредите свој узорак са разним познатим бактеријама тако што ћете га ставити на различите културе културе подстакните раст неких врста, а инхибирајте друге, или испитивањем узорка на различите познате бактерије нуспроизводи. Као крајње решење, секвенцирање ДНК може утврдити да ли имате познату или непознату бактеријску врсту или сој, под условом да га упоређујете са врстом или сојем чији је геном већ секвенциран.