Крчење шума и деградација шума стварају еколошке проблеме у свим деловима света. Крчење шума дешава се брзим темпом, посебно у тропским регионима где се сваке године посеку милиони хектара. Преостале шуме такође пате од загађења и селективних операција сече које нарушавају интегритет локалних екосистема. Уништавање шума такође утиче на квалитет тла и воде у непосредној близини и може имати негативан утицај на биодиверзитет у низу повезаних екосистема.
Губитак биодиверзитета
Најзначајнији ефекат деградације шума је губитак станишта што доводи до губитка врста. Шуме су међу биолошки најразноврснијим екосистемима на планети. Преко половине свих копнених врста живи у прашумама, које су изложене највећим притисцима крчења шума. Губитак биодиверзитета може се десити и током селективне сече, јер поједине врсте могу бити нетолерантне на губитак одређене врсте дрвећа или на присуство операција сече. Губитак врста унутар шума може се проширити на околне екосистеме, јер ланци исхране често прелазе границе екосистема.
Поремећај циклуса воде и речних екосистема
Евапотранспирација се односи на воду која испарава из шуме натраг у атмосферу, повећавајући количину падавина у оближњим екосистемима. Губитак шуме нарушава овај циклус, што резултира мањом количином падавина и узрокујући сушније услове у широким околним подручјима, што понекад доводи до суше. Шуме такође задржавају влагу од падавина, омогућавајући јој да пуни водостаје и регулишући проток воде у реке и друге водене токове. Губитак шума често резултира повећаним поплавама и ерозијом седимента у рекама, нарушавајући речне екосистеме.
Ерозија тла
Шуме садрже посебно богато земљиште које је добијало органски материјал током дужег временског периода. Када се шума уништи, тло је изложено сунцу, због чега губи хранљиве састојке. Током јаких киша суво тло се испире због недостатка коренових структура у земљи. Једном када се површинско земљиште изгуби на неком подручју, може бити веома тешко поново успоставити шуму или користити земљу у друге производне сврхе.
Глобално загревање
Крчење шума је примарни узрок емисије угљен-диоксида изазваних људима, што доводи до глобалног загревања. Све шуме садрже велике количине угљеника. Када се униште, сагоревањем или распадањем шумских материја овај угљеник се ослобађа у атмосферу у облику угљен-диоксида. Угљен-диоксид је гас са ефектом стаклене баште, који апсорбује сунчеву топлоту у атмосфери. Због тога веће концентрације атмосферског угљен-диоксида доводе до топлије климе. Глобално загревање глобално угрожава екосистеме и биодиверзитет.