Све почиње од корена. Биљке добијају хранљиве материје из два различита система - један почиње у лишћу и одговоран је за фотосинтезу. Други започиње од корена и помера воду напуњену раствореним јонима кроз биљку. Протеини су један од хранљивих састојака који започињу у корену и раде према горе.
Биљке су аутотрофи
Биљке су аутотрофи. За разлику од животиња, које храну морају добивати из спољних извора, као што су биљке и друге животиње, биљке су способне да производе своју. Биљке узимају основне елементе из спољног света и уносе их у своја тела, где се претварају у скробове и протеине које биљка може користити или животиња која их једе.
Азот и бактерије
Протеини су направљени од нитрата, облика азота који су фиксирали микроорганизми. Биљке не могу директно да користе азот, па се ослањају на бактерије да претворе азот у облик који могу да користе. Ове бактерије бораве у близини корена биљака или у посебним структурама на корену које се називају чворови. Бактерије у чворовима створиле су симбиотски однос са биљкама где из биљке размењују употребљиви азот за шећер.
Нитрати и аминокиселине
Нитрати који се уносе у биљку кроз корење увлаче се у биљку, где се претварају у 20 различитих врста аминокиселина. Ове аминокиселине су претворене у протеине у посебним структурама у ћелијама које се зову рибосоми. Ове структуре се налазе на четири места у погону. Неки плутају слободно у цитоплазми ћелија, док су други причвршћени за површину ендоплазматског ретикулума, митохондрија и хлоропласта.
Транспорт протеина
Из рибосома садржаних у ендоплазматском ретикулуму, протеини се шаљу у голгијев апарат. Апарат голги сортира те протеине за дистрибуцију кроз биљку, где ће се користити за формирање нових структура за даљи транспорт хранљивих састојака, као и основне метаболичке процесе.
