Микроскоп постоји врло дуго. Изумљена током 16. века, од тада се технологија непрекидно усавршава. Давно превазилазећи једноставни класични модел стаклене цеви, микроскоп се данас користи у различитим контекстима у предузећима која су различита од аутомобилске и индустрије лекова. Природне границе људског ока непрестано се повећавају како би се испунили основни индустријски задаци.
Делови који су укључени у компликоване модерне машине, попут аутомобила, постали су толико мали да је употреба микроскопа неизбежна. Користећи микроскоп посебно дизајниран за тај задатак, инжењери могу проценити и најмањи зупчаник на недостатке и преломе. На овај начин се користе и микроскопи за инспекцију делова машина као што су сатови и мотори који се користе за погон бродова и авиона.
Инжењеринг материјала постајао је све сложенији како се развијају нови материјали за најразличитије задатке. Користећи посебно дизајниране материјале, инжењери су побољшали све, од грађевинских конструкција до материјала за паковање, до одеће коју људи носе. Микроскоп је био пресудан у овом процесу, омогућавајући стручњацима да прегледају основне облике материјала које стварају. Употреба микроскопа постаће важнија само са новим наноматеријалима.
Микроскопи су увек били пресудно средство у медицинској професији. Микроскопи су омогућили откриће теорије о клицама које су се промениле у свету и спасили безброј живота. Данас се микроскопи користе за посматрање бактерија и микроба, као и за развој нових хемикалија и лекова који се користе у борби против болести. Развој нових лекова у великој мери помаже употреба снажних микроскопа.