Микроскопи нам помажу да видимо тако мале предмете да их људско око иначе не би видело. Међутим, врло су деликатне и често ће се сломити ако се злоупотребе или испадну. Правилна употреба микроскопа је најважнија за осигуравање добрих резултата и одржавање његовог стања. Правилна нега може у великој мери продужити живот микроскопа и уштедети новац власника.
Прво што вам треба је тобоган са примерком на њему. Ставите кап воде на узорак док је на тобогану, а затим ставите покривач на узорак. Не испуштајте поклопац директно на врх клизача, јер ћете испод поклопца завршити мехурићи. Поставите једну ивицу поклопца на једну страну узорка, а затим спустите другу страну преко узорка.
Поставите дијапозитив на сцену микроскопа, причвршћујући га помоћу копча. Употребите најнижи објектив, који је сочиво најудаљеније од дијапозитива, да бисте пронашли примерак. Увек почните са овим увећањем. Након што нађете узорак, центрирајте га помицањем клизача врло споро. Ако желите да се примерак помери доле према центру, морате померити клизач нагоре. Исто као и десно и лево: Морате померити клизач у супротном смеру у ком желите да иде ваш примерак. Једном када сте пронашли и центрирали свој примерак, можете почети да га увећавате.
Када центрирате примерак, промените објектив у средњи и покушајте да га поново центрирате. Ако изгубите из вида циљ, мораћете да се вратите на малу снагу и поново га пронађете. Ако сте свој циљ пронашли на средњој снази, покушајте да ограничите количину светлости микроскопа како бисте лакше видели детаље узорка. Живи примерци не воле светлост, па сте са мање светлости често успешнији у проналажењу примерка. Ако се одлучите за велику снагу, усредсредите објектив и пребаците поново. Не користите грубо подешавање фокуса на великој снази, јер сочиво једва треба да очисти клизач. Ако користите груби фокус, на крају можете оштетити сочиво, узорак и клизање. Ово не би требало да буде велико питање, јер научници често користе ниже или средње циљеве.