Pretočna citometrija je metoda preučevanja celic in kromosomov. Vsako sekundo lahko analiziramo na tisoče teh mikroskopskih delcev. To se naredi z aparati za zaznavanje, medtem ko so celice v tekočini. Tehnika se uporablja iz številnih razlogov, na primer za preučevanje in diagnosticiranje raka krvi. Tej metodi obstajajo druge možnosti, zato je vredno preučiti prednosti in slabosti pretočne citometrije.
Če se s pretočno citometrijo uporablja za preučevanje heterogenih populacij celic, bo subpopulacije analizirala v nekaj minutah. Ne samo, da je veliko hitrejši od drugih možnosti, tudi podatki, ki jih ustvari, so podrobni. Analiza vključuje odstotek rdečih celic v primerjavi z zelenimi celicami, lahko pa gre še dlje z zagotavljanjem informacij o svetlo zelenih in dolgočasno zelenih celicah.
Uporaba pretočne citometrije za pregled enotnih populacij celic ima prednost, da vedno poudari kakršno koli neenotnost. Pri zagotavljanju končnih podatkov odstrani tudi ostanke ali odmrle celice. Ta stopnja natančnosti presega raven konkurence.
Pri preučevanju enakomerne populacije celic je običajno, da bodo želeni podatki povprečne gostote receptorjev. Pretočna citometrija lahko to delo opravi enostavno, vendar je dražja od alternativ, kot sta radioimunski test in imunsko-encimski test. Težava je v tem, da lahko te alternative opravijo delo enako hitro in lahko celo proizvedejo več vzorcev na dan. Pretočna citometrija vam daje povprečno gostoto, a tudi ogromno informacij, ki jih za takšno službo ne potrebujete.
Sorterji pretočne citometrije so zelo natančni in čistijo majhne ali kompleksne subpopulacije. Toda tudi hitrorazvrščevalnik včasih ni dovolj hiter, da bi dosegel želene rezultate. Na primer, par celic pogosto zavržemo, ker razvrščevalnik ne more pravočasno razlikovati med njimi. Hitro razvrščevalnik lahko pri delu s subpopulacijo, ki predstavlja 20 odstotkov celotne populacije, da do 106 celic na uro. Ta stopnja je prenizka za številne poskuse.