Struktura dvoverižne DNA je univerzalna v vseh živih celicah, razlike pa se pojavljajo pri metodah za pridobivanje genomske DNA iz živalskih in rastlinskih celic. Čeprav genomska DNA živi v jedru celic, sta količina in čistost ekstrahirane DNA odvisna od vrste in velikosti celice. Na primer, nekatere celice vsebujejo več DNA in nečistoč kot druge. Preberite, če želite izvedeti več o razlikah pri ekstrakciji DNA.
Splošna ekstrakcija DNA
Če rastlinske in živalske celice zdravite z milnico, bo to razgradilo lipide v celicah in jedrskih membranah. Nato se bo zmes DNA ločila od celičnih membran in beljakovin. Nato lahko z alkoholom oborite DNA v raztopini. Odvisno od količine v vzorcu je lahko DNA vidna s prostim očesom. Vendar ne pozabite, da ta preprost postopek ne daje nujno DNK visoke čistosti.
Rastlinske in živalske celice
Rastlinske celice se od živalskih celic razlikujejo po svoji togi celični steni in organelah, kot je kloroplast. Vsebujejo tudi beljakovine in encime, ki igrajo vlogo pri fotosintezi. Nekatere rastlinske celice imajo poliploidijo, kar pomeni, da imajo več celic vsakega kromosoma na celico. Poleg tega celični procesi v rastlinah, kot je fotosinteza, proizvajajo vrsto sekundarnih presnovkov. Živalske celice nimajo celične stene, vendar še vedno potrebujejo kemikalije, kot je natrijev dodecil sulfat (SDS), da motijo celično membrano in sproščajo genomsko DNA.
Ekstrakcija rastlinske DNA
Genomsko DNA rastlin je težje izvleči zaradi rastlinske celične stene. Odstranite ga lahko s homogenizacijo ali z dodajanjem celulaze za razgradnjo celuloze, ki tvori celično steno. Poleg tega lahko presnovki, prisotni v rastlinski celici, motijo ekstrakcijo genomske DNA tako, da med postopkom obarjanja onesnažijo vzorec DNA.
Ekstrakcija DNK živali
Levkociti v periferni krvi so glavni vir genomske DNA živali, vendar je odvzem vzorcev težaven, ker mora kri prihajati neposredno od živali. Kri vsebuje vrsto spojin, kot so beljakovine, lipidi, bele krvne celice, rdeče krvne celice, trombociti in plazma, ki lahko onesnažijo vzorec DNA. Vendar pa je primarni onesnaževalec živalske DNK, odvzet iz vzorcev krvi, hem, ki je beljakovinska komponenta hemoglobina.
Razlike v DNK
Razlike med rastlinsko in živalsko DNK so v zaporedju baz v vijačnici. Spojine, ki jih najdemo v rastlinskih celicah, v živalskih celicah niso prisotne in zaporedja baz DNA kažejo to. Tudi genomska rastlinska DNA je pogosto večja od živalske. Te razlike vplivajo tudi na metode ekstrakcije, donos in čistost DNA.