Kako izračunati izoelektrično točko peptidov

Peptidi so kratki polimerni fragmenti, sestavljeni iz aminokislin. Vsak peptid ima določeno aminokislinsko zaporedje, označeno s tri črko ali eno črko; na primer aminokislina alanin je okrajšana kot "Ala" ali "A." Naboj peptidov v raztopini je odvisen od kislosti raztopine. Izoelektrična točka (pI) se nanaša na vrednost kislosti raztopine, pri kateri ima molekula peptida neto naboj nič. Topnost peptida je na izoelektrični točki minimalna. Za izračun vrednosti pI za zaporedje aminokislin peptidov uporabite razpoložljive spletne strežnike.

Zapišite zaporedje peptidov z enočrkovno kodo. Na primer, če ima peptid aminokislinsko zaporedje Ala-Ser-Glu-Leu-Pro (Alanin-Serin-Glumatična kislina-Levcin-Prolin), potem je enočrkovno zaporedje "ASELP." Po potrebi si oglejte tabelo za pretvorbo treh črk v eno črko, podano v Viri.

Na primer s katerim koli spletnim brskalnikom, Internet Explorerjem ali Firefoxom se pomaknite do strežnika, ki izračuna izoelektrično točko peptida (pI); glejte Viri.

Odčitajte vrednost izoelektrične točke (pI), podano v vrstici "Teoretični pI / Mw." V našem primeru je pI 4,00. Upoštevajte, da strežnik izračuna tudi molekulsko maso (Mw) peptida.

O avtorju

Oxana Fox je samostojna pisateljica, specializirana za medicino in zdravljenje, računalniško programsko in strojno opremo, digitalno fotografijo in finančne storitve. Leta 1988 je diplomirala na Moskovski medicinski šoli s formalnim izobraževanjem iz pediatrije.

Foto krediti

Comstock Images / Comstock / Getty Images

  • Deliti
instagram viewer