Za čiščenje vode je bistvenega pomena čiščenje vode. Vodo je treba očistiti, da se odpravijo zajedavci, ki povzročajo amebno dizenterijo in giardije. Obstaja več različnih metod za čiščenje vode. Nekatere so kemične metode, druge pa ne; nekateri so pri čiščenju vode učinkovitejši od drugih.
Jod
Pogosta je uporaba metod na osnovi joda za čiščenje vode. Takšne metode vključujejo jodne tablete, raztopino joda in razkužilo Polar Pure Water. Ko uporabljate jodne tablete, morate pri čiščenju hladne vode imeti vsaj 30 minut časa in približno 10 minut, če je voda vroča. Ko uporabljate raztopino joda, morate pustiti 30 minut za čiščenje hladne vode in 15 minut za vročo vodo. Razkužilo Polar Pure Water je vrsta steklenic, ki vsebuje kristale joda. Vse, kar morate storiti, je, da steklenico napolnite z vodo in sledite priloženim navodilom, ker se navodila razlikujejo glede na proizvajalca steklenice.
Klor
Pogosta je tudi uporaba metod na osnovi klora za čiščenje vode. Takšne metode vključujejo tablete klora in super-kloriranje. Klorove tablete Giardia ne bodo uničile same, zato jih je treba uporabljati skupaj s finim filtrom. Znano je, da je superkloriranje učinkovito in uporablja velike odmerke klora. Po uporabi velikega odmerka ga kasneje nevtraliziramo z vodikovim peroksidom.
Filtri za vodo
Uporaba vodnega filtra za prečiščevanje vode postaja vse bolj priljubljena v razvitih državah, kot so ZDA. Te filtre lahko dodate v pipo za umivalnik ali v posebej zasnovan vrč za vodo. Vsi ti filtri so različni, navodila pa se razlikujejo, odvisno od proizvajalca.
Vreti
Vrelo vodo je najlažje očistiti. Ta metoda je učinkovita tudi pri odstranjevanju velike količine parazitov. Ko zavremo, je pomembno, da zavre in nato vre vsaj 10 do 15 minut ter dodamo dodatno minuto za vsakih 300 metrov nadmorske višine. Med vrenjem nekateri paraziti umrejo manj kot minuto. Nekateri - na primer hepatitis A - trajajo dlje, zato je pomembno, da skušamo izvreti vse parazite.
Destilacija
Destilacija je način za prečiščevanje vode. Večino ustekleničene vode očistimo z destilacijo. Po destilaciji bodo še vedno prisotne različne organske spojine in nekatere nečistoče, kot so silicijev dioksid, ogljikov dioksid in amoniak. Med destilacijo voda zaradi segrevanja izhlapi in nato se zbirajo kondenzirane pare.