Encimi so spojine na osnovi beljakovin, ki olajšajo specifične kemijske reakcije v živih organizmih. Encime lahko uporabimo tudi v medicinskem in industrijskem okolju. Izdelava kruha, izdelava sira in varjenje piva so odvisni od aktivnosti encimov - in encimi se lahko zavirajo, če je njihovo okolje preveč kislo ali preveč bazično.
Okolje pH pomembno vpliva na encime. Lahko vpliva na intramolekularne sile in spremeni obliko encima - potencialno do točke, ko postane neučinkovit. Ob upoštevanju teh učinkov imajo tipični encimi območje pH, v katerem delujejo optimalno. Na primer, alfa amilaza, ki jo najdemo v ustih, najučinkoviteje deluje v bližini nevtralnega pH. Vendar pa lipaze bolje delujejo pri bolj osnovnih pH. Puferski sistemi, vgrajeni v večino organizmov, preprečujejo, da bi ravni pH dosegle točko, ko bistveni encimi postanejo neučinkoviti. Če zaradi ravni pH encim postane neučinkovit, lahko prilagajanje pH povzroči, da encim ponovno postane učinkovit.