Ocenjuje se, da je 80 odstotkov zelenih cvetočih rastlin na svetu v amazonskem deževnem gozdu. Na 2,5 hektarjih amazonskega deževnega gozda je približno 1500 vrst višjih rastlin (praproti in iglavcev) in 750 vrst dreves. Ni natančno znano, koliko amazonskih rastlin v deževnih gozdovih je ogroženih, vendar lahko z gotovostjo trdimo, da jih je veliko resnično ogroženih ali pa so na robu. Nekateri razlogi so lovci na orhideje, sečnja, kmetovanje, krčenje gozdov in komercialni razvoj.
Orhideje
Orhideje spadajo med najbolj ogrožene rastline deževnih gozdov v Amazoniji. Obstaja več kot 25.000 vrst orhidej in vse so bodisi ogrožene bodisi ogrožene. Veliko vrst je že izumrlo. To so največje cvetoče rastline na svetu in so v najrazličnejših barvah in oblikah. Cvet orhideje je lahko večji od človeške roke in lahko zraste do nekaj metrov.
Rafflesia Flower
Ta amazonski cvet deževnih gozdov velja za eno najredkejših in najbolj ogroženih rastlin na svetu. Lahko tehta več kot šest kilogramov in lahko doseže približno en meter v širino. Podoben je pravljični gobi z rdečimi cvetnimi listi, središčem rumene barve in bezgavkami.
Mangrove drevesa
Ta ogrožena drevesa najdemo ob obalnih obalah amazonskega deževnega gozda. Preprečujejo erozijo tako, da upočasnjujejo pretok sedimenta, ko napreduje ob rekah in potokih, in varujejo obalo deževnega gozda.
Kapok Tree
To veliko tropsko drevo lahko zraste do višine 150 čevljev. Veje se dobro razprostirajo od debla in rastejo v vodoravnih plasteh, zaradi česar je dobro gnezdišče za ptice, krošnja pa je v obliki dežnika. Žabe se razmnožujejo in živijo v bromelijskih bazenih v spodnjih delih drevesa, sesalci pa v visokih vejah in jih uporabljajo tudi kot avtoceste.
Ekvadorski cvet deževnega gozda
Cvet te ogrožene rastline je majhen, rumen in vijoličen. Kot že ime pove, ga najdemo v ekvadorski regiji amazonskega deževnega gozda.
Bromelije
V amazonskem deževnem gozdu je več kot 2.700 vrst bromelij, približno tretjina pa jih je ogroženih. Nekatere bromelije so tako težke, da lahko zlomijo drevesa, s katerih rastejo. Ananas in španski mah sta dve najpogostejši bromeliji. Žabe strupene puščice odložijo jajčeca v ogroženi bromeliji cisterne.