Ribozómy sú štruktúry v bunkách s jedinou kritickou funkciou: tvoriť proteíny.
Samotné ribozómy pozostávajú z asi jednej tretiny hmotnostného proteínu; ďalšie dve tretiny pozostávajú zo špecializovanej formy nazývanej ribonukleová kyselina (RNA) ribozomálna RNAalebo rRNA. (Čoskoro stretnete ďalších dvoch hlavných členov rodiny RNA, mRNA a tRNA.)
Ribozómy sú jednou zo štyroch odlišných entít, ktoré sa nachádzajú vo všetkých bunkách, nech sú bunky akokoľvek jednoduché. Ďalšie tri sú kyselina deoxyribonukleová (DNA), a bunková membrána a cytoplazma.
V najjednoduchších organizmoch tzv prokaryoty, ribozómy voľne plávajú v cytoplazme; v zložitejšom eukaryoty, nachádzajú sa v cytoplazme, ale aj v množstve iných miest.
Časti bunky
Ako bolo uvedené, prokaryoty - jednobunkové organizmy, ktoré tvoria domény Baktérie a Archaea - majú štyri spoločné štruktúry pre všetkých bunky.
Sú to:
- DNA: Táto nukleová kyselina obsahuje všetky genetická informácia o svojom materskom organizme, ktorý sa prenáša do ďalších generácií. Jeho „kód“ sa tiež používa na výrobu proteínov prostredníctvom sekvenčných procesov transkripcie a translácie.
- Bunková membrána: Táto dvojitá plazmatická membrána, pozostávajúca z fosfolipidovej dvojvrstvy, je selektívne priepustná membrána, ktorá umožňuje niektorým molekulám nerušený priechod, zatiaľ čo bráni vstupu do iných. Poskytuje tvar a ochranu všetkým bunkám.
- Cytoplazma: Cytoplazma, ktorá sa tiež nazýva cytosol, je želatínová matrica vody a bielkovín, ktorá slúži ako látka vo vnútri bunky. Uskutočňuje sa tu množstvo dôležitých reakcií, a práve tu sa nachádza najviac ribozómov.
- Ribozómy: Nachádzajú sa v cytoplazme všetkých organizmov a inde v eukaryotoch. Sú to proteínové „továrne“ na bunky a pozostávajú z dvoch podjednotiek. Obsahujú stránky, kde preklad vyskytuje.
Eukaryoty mať zložitejšie bunky, obsahujúce organely, ktoré sú obklopené rovnakým druhom dvojitej plazmatickej membrány, ktorá obklopuje bunku ako celok (bunková membrána). Niektoré z týchto organel, predovšetkým endoplazmatické retikulumsú hostiteľmi veľkého množstva ribozómov. Chloroplasty rastlín ich má, rovnako ako mitochondrie všetkých eukaryotov.
Endoplazmatické retikulum (ER) je ako „diaľnica“ medzi jadrom bunky a cytoplazmou a dokonca aj samotnou bunkovou membránou. Prepravuje okolo seba bielkovinové produkty, a preto je výhodné, aby ribozómy, ktoré tieto proteíny tvoria, boli susedmi s ER.
Keď sú ribozómy viazané na ER, výsledok sa volá hrubý ER (RER). Volá sa ER nedotknutá ribozómami hladký ER (SER).
Preklad definovaný
Preklad je posledným krokom v procese bunky vykonávajúcej genetické pokyny. Začína to v istom zmysle výrobou DNA messenger RNA (mRNA) v procese tzv prepis. MRNA je akýsi „zrkadlový obraz“ DNA, z ktorej bola kopírovaná, obsahuje však rovnaké informácie. Potom sa mRNA viaže na ribozómy.
MRNA je spojená s ribozómom špecifickými molekulami prenosová RNA (tRNA), ktoré sa viažu na jednu a iba jednu z 20 aminokyselín nachádzajúcich sa v prírode. Ktorý aminokyselina zvyšky sa privedú na web - teda, ktorý tRNA dorazí - je určená sekvenciou nukleotidových báz na vlákne mRNA.
mRNA obsahuje štyri bázy (A, C, G a U) a informácie o danej aminokyseline sú obsiahnuté v troch po sebe nasledujúcich bázach, ktoré sa nazývajú tripletový kodón (alebo niekedy len kodón), ako sú ACG, CCU atď. To znamená, že sú 43alebo 64 rôznych kodónov. To je viac ako dostatočné na kódovanie 20 aminokyselín, a preto sú niektoré aminokyseliny kódované viac ako jedným kodónom (redundancia).
Aminokyseliny a bielkoviny
Aminokyseliny sú stavebnou jednotkou bielkovín. Kde bielkoviny pozostávajú z polymérov aminokyselín, nazývaných tiež polypeptidy, aminokyseliny sú monoméry týchto reťazcov.
(Rozdiel medzi polypeptidom a proteínom je zväčša svojvoľný.)
Aminokyseliny zahŕňajú centrálny atóm uhlíka spojený so štyrmi odlišnými zložkami: atóm vodíka (H), aminoskupinu (NH)2), skupina karboxylovej kyseliny (COOH) a reťazec na strane R, ktorý dáva každej aminokyseline jej jedinečný vzorec a charakteristické chemické vlastnosti. Niektoré z bočných reťazcov majú afinitu k vode a iným elektricky polárnym molekulám, zatiaľ čo bočné reťazce iných aminokyselín sa správajú opačne.
Syntéza proteínov, ktorá spočíva v jednoduchom pridávaní aminokyselín od začiatku do konca, zahŕňa väzbu aminoskupiny jednej aminokyseliny na karboxylovú skupinu nasledujúcej. Toto sa nazýva a peptidová väzba, a vedie k strate molekuly vody.
Zloženie ribozómu
Dá sa povedať, že ribozómy pozostávajú z ribonukleoproteín, pretože, ako je opísané vyššie, sú zostavené z nerovnakej zmesi rRNA a proteínov. Skladajú sa z dvoch podjednotiek, ktoré sú klasifikované z hľadiska ich sedimentačného správania: veľká, 50S podjednotka a malý, 30S podjednotka. („S“ tu znamená jednotky Svedberg.)
Veľká podjednotka obsahuje 34 rôznych proteínov spolu s dvoma typmi rRNA, 23S a 5S. Malá podjednotka obsahuje 21 rôznych proteínov a typ rRNA, ktorá sa prihlasuje pri 16S. Pre obe podjednotky je spoločný iba jeden proteín.
Samotné komponenty podjednotiek sa vyrábajú v jadierko vo vnútri jadier prokaryotov. Potom sa transportujú cez pór v jadrovom obale do cytoplazmy.
Funkcia ribozómu
Ribozómy neexistujú v úplne zostavenej podobe, kým nie sú vyzvaní, aby vykonávali svoju prácu. To znamená, že podjednotky trávia všetok svoj „voľný čas“ osamote. Takže keď prebieha prekladanie v konkrétnej časti danej bunky, ribozómové podjednotky v okolí sa začínajú opäť zoznamovať.
Veľa z funkcie väčšej podjednotky sa týka katalýza, alebo urýchlenie chemických reakcií. Toto je zvyčajne oblasť nazývaná proteíny enzýmy, ale aj iné biomolekuly občas pôsobia ako katalyzátory a príkladom sú časti veľkej ribozomálnej podjednotky. Toto robí funkčnú zložku a ribozým.
Naproti tomu sa zdá, že malá podjednotka má skôr funkciu dekodéra, čím sa preklad dostane na úplný začiatok fázy uzamknutím na pravú veľkú podjednotku na správnom mieste v správnom čase a prenesením toho, čo dvojica potrebuje scéna.
Kroky prekladu
Preklad má tri hlavné fázy: Iniciácia, predĺženie a ukončenie. Stručné zhrnutie každej z týchto častí prepisu:
Iniciácia: V tomto kroku sa prichádzajúca mRNA viaže na škvrnu na malej podjednotke ribozómu. Špecifický mRNA kodón spúšťa iniciáciu pomocou tRNA-metionín. Je tam spojený špecifickou kombináciou tRNA-aminokyselina určenou sekvenciou mRNA z dusíkaté bázy. Tento komplex sa pripája k veľkej ribozomálnej podjednotke.
Predĺženie: V tomto kroku sú zostavené polypeptidy. Keď každý prichádzajúci komplex aminokyselina-tRNA pridá svoju aminokyselinu k väzobnému miestu, prenesie sa to do a blízke miesto na ribozóme, druhé väzobné miesto, ktoré drží rastúci reťazec aminokyselín (t. j polypeptid). Prichádzajúce aminokyseliny sa teda „odovzdávajú“ z jedného miesta na druhé na ribozóme.
Ukončenie: Keď je mRNA na konci svojej správy, signalizuje to konkrétnou základnou sekvenciou, ktorá označuje „stop“. To spôsobuje akumuláciu „uvoľňovacích faktorov“, ktoré bránia väzbe ďalších aminokyselín na polypeptid. Syntéza proteínov v tomto ribozomálnom mieste je teraz dokončená.