Po nasmerovaní vzoriek DNA na agarózový gél a nasnímaní obrázka si môžete obrázok odložiť na neskôr, potom môžete výsledky analyzovať a interpretovať. Druhy vecí, ktoré hľadáte, budú závisieť od povahy vášho experimentu. Ak napríklad robíte odtlačky prstov DNA, budete chcieť porovnať veľkosť kúskov DNA z dvoch vzoriek - z podozrivej vzorky a prípadne zo vzorky miesta činu. Ak pracujete s plazmidmi z baktérií, budete možno musieť skontrolovať, či plazmid obsahuje inzert. To, ako interpretujete svoj gél, bude teda čiastočne závisieť od experimentu, ktorý ste vykonali. Existuje niekoľko všeobecných pravidiel, ktoré môžete uplatniť.
Upozorňujeme, že možno budete musieť použiť pokyny v tejto časti. Elektroforéza na agarózovom géle sa často používa na potvrdenie, že plazmid obsahuje daný inzert. Ak nepracujete s plazmidmi, môžete túto časť preskočiť. Ak však ste, môžete postupovať podľa týchto pokynov.
Všimnite si, že ak pracujete s nezostrihanými alebo prezretými plazmidmi, nemôžete odhadnúť veľkosť pomocou postupu z časti 1 vyššie. Je to preto, že nezostrihané a prezývané plazmidy migrujú rôznou rýchlosťou z lineárnej DNA.
Porovnajte počet pásiem v každom pruhu. Pripomeňme, že reštrikčný enzým štiepi DNA na miestach, kde sa vyskytuje daná sekvencia nazývaná reštrikčné miesto. Pokiaľ bola vzorka ošetrená DVA reštrikčnými enzýmami, mal by byť prítomný pás pre inzert aj pás pre zvyšok plazmidu. Je to preto, že inzert bude lemovaný dvoma reštrikčnými miestami, každé pre iný enzým, takže rezy na oboch týchto miestach uvoľnia inzert z plazmidu. Strih iba na jednom mieste naopak prevedie plazmid na lineárnu DNA. Vzorka narezaná bez reštrikčných enzýmov alebo jedného reštrikčného enzýmu by potom mala obsahovať jeden pás, zatiaľ čo vzorka narezaná dvoma reštrikčnými enzýmami by mala obsahovať dva pásy.
Dávajte pozor na pásy vytvorené prezývanou plazmidovou DNA. Prezretý plazmid má rez iba v jednom vlákne, takže migruje pomalšie ako rezaný plazmid. Rezané plazmidy zasa migrujú pomalšie ako nerozrezaná DNA.
Odhadnite veľkosť vložky pomocou postupu popísaného v časti 1 a určite, či zodpovedá vašim očakávaniam (ktoré sa budú líšiť v závislosti od experimentu).
Veci, ktoré budete potrebovať
- Ceruzka
- Papier
- Tabuľkový program
- Obrázok vášho gélu
- Vládca