Ekosystémy dažďového pralesa poskytujú domov niektorým z najhustejších a najrozmanitejších spoločenstiev zvierat na Zemi. Dažďové pralesy sú však neustále využívané pre svoje bohaté zdroje. Ľudské praktiky, ako je ťažba a odlesňovanie, majú vážne účinky na tieto biotopy, čo spôsobuje alarmujúce tempo pri nespočetných druhoch zvierat.
Vtáky
Niekoľkým druhom tukanov, papagájov a iných tropických vtákov juhoamerických a stredoamerických dažďových pralesov hrozí vyhynutie v dôsledku ťažby dreva a iných príčin odlesňovania. Orol harpyjský, jeden z najväčších známych druhov orlov na svete, sa darí v nížinách tropických dažďových pralesov od južného Mexika po východnú Bolíviu; biotop tohto vtáka sa neustále zmenšuje v dôsledku jasných postupov odlesňovania, ako aj ničenia miest hniezdenia v dôsledku priemyselných postupov, ako sú ťažba a ťažba ropy. Strata biotopov tiež ohrozuje tisíce druhov sťahovavých vtákov. Tieto druhy cestujú počas severoamerického leta na sever a počas zimy späť do trópov; čoraz viac sa každý rok vracia a nenájde žiadny domov ani zničené hniezdiská.
Cicavce
V dažďových pralesoch stráca svoje domovy široká škála druhov cicavcov, od najmenšieho hlodavca po najväčšieho predátora. Mnoho väčších cicavcov potrebuje dostatok priestoru na hľadanie potravy alebo lovu. S rozvojom priemyselných postupov v určitých oblastiach sa cicavce dažďových pralesov, ako sú gorily, jaguáre a pumy, musia obmedziť na rozdrobené biotopy s nedostatočnými zdrojmi. Odlesňovanie najpriamejšie postihuje stromové cicavce (tie, ktoré žijú na stromoch), napríklad veverica lietajúca a netopier ovocný, ako aj niekoľko druhov opíc. Celé komunity zostávajú bez domova a nútia ich prispôsobiť sa prostrediu bez stromov, na ktoré nie sú pripravené.
Plazy a obojživelníky
Odlesňovanie je hlavnou príčinou straty biotopov pre väčšinu plazov dažďových pralesov, zatiaľ čo mnoho druhov obojživelníkov tiež prichádza o svoje domovy kvôli ropné vrty a ťažobné praktiky, ktoré znečisťujú rybníky, rieky a potoky, a nútia ich hľadať nové zdroje vody pre svoj semikvatický životný štýl. Medzi ohrozené a ohrozené druhy plazov a obojživelníkov patrí zlatá ropucha, madagaskarský denný gekón a leguán, ako aj niekoľko druhov šípkových žab, najmä z Kolumbie.