Fosílne záznamy naznačujú, že rozmanitosť druhov na planéte nikdy nebola stabilná. Namiesto toho diverzita rástla a klesala v prírodných cykloch, ktoré trvali desiatky miliónov rokov. Problémom, ktorým dnes ľudia čelia, je odhadovaná miera úbytku druhov, ktorá je takmer 1 000-krát vyššia ako historická miera. Pokles biodiverzity nezahŕňa iba stratu druhov. Zahŕňa to aj stratu genetickej diverzity druhov a stratu ekosystémov. Môže to znamenať, že biodiverzita bola skôr poškodená než úplne stratená. Ľudia vždy využívali prírodu, ale s rastom globálnej populácie v posledných storočiach exponenciálne rástol aj vplyv ľudstva na biodiverzitu.
Nadmerné vykorisťovanie
Početné druhy zvierat, bezstavovcov a rastlín sú vyhynuté alebo ohrozené v dôsledku ľudského vykorisťovania. Ľudia využívajú prírodné zdroje na jedlo, šport, stavebné materiály, medicínu a kultúrne účely - a robili to s oveľa väčšou vôľou, než si spoločnosť uvedomila viac ohľaduplne k životnému prostrediu. Pokusy ľudstva porozumieť životnému prostrediu sa začali zhruba pred 160 rokmi a otázky biodiverzity sa stali súčasťou verejnej diskusie až koncom 20. storočia. Do tejto doby už došlo k veľkému poklesu biodiverzity. Pokles biodiverzity pokračuje v dôsledku rýchlo sa rozširujúcej ľudskej populácie. Biotop je poškodený, aby uspokojil rastúce potreby v oblasti poľnohospodárstva, rozvoja miest, vody a materiálov. Ryby, divá zver a rastliny sú nadmerne vyťažené, a to aj napriek množiacim sa dôkazom, že mnohé spôsoby zberu sú neudržateľné.
Znečistenie a globálne otepľovanie
Znečistenie suchozemských a vodných ekosystémov fyzikálnymi znečisťujúcimi látkami, ako sú chemikálie, svetlo a hluk, ako aj biologickými znečisťujúce látky vo forme inváznych druhov a chorôb, spôsobil degradáciu ekosystému zmenou druhovej rozmanitosti a biomasa. Vedecká komunita je naďalej nejednotná v otázke, či je príčinou znečistenie ovzdušia spolu s čistením lesov globálne otepľovanie. Bez ohľadu na príčinu predstavuje rýchle tempo súčasného globálneho otepľovania problém pre biodiverzitu. Je pravdepodobné, že mnoho druhov nebude mať čas prispôsobiť sa meniacim sa podmienkam biotopu, a tak sa obmedzí na menšie časti pôvodného biotopu alebo vyhynie. Vedci predpovedajú, že zmena podnebia zvýši frekvenciu prírodných porúch a vytvorí viac stresu pre biodiverzitu.
Strata odolnosti ekosystému
Zakaždým, keď ľudia poškodia ekosystém, zvyšujú tiež pravdepodobnosť, že biodiverzita poklesne v dôsledku budúcich zmien životného prostredia. Zdravé ekosystémy majú vlastnosti, ktoré ich chránia pred zmenami v životnom prostredí. Medzi tieto vlastnosti patrí genetická diverzita v rámci druhov i medzi nimi; ekosystémové prepojenie, pojem, ktorý sa vzťahuje na množstvo neporušeného biotopu dostupného pre rastliny a živočíchy; a rozsiahle geografické rozloženie populácií. Rôznorodý genofond zaisťuje, že niektorí členovia druhu budú mať vlastnosti, ktoré im umožnia prežiť zmeny. Pripojenie k biotopu zaručuje, že ľudia v núdzi majú schopnosť presťahovať sa do lepšieho biotopu. Populácia rozložená na veľkej geografickej oblasti je menej náchylná na miestne vyrušovanie v porovnaní s populáciou, ktorej rozsah je obmedzený na malú oblasť. Schopnosť súčasných ekosystémov vyrovnávať zmeny v životnom prostredí, napríklad globálne otepľovanie, bola významne znížená predchádzajúcimi ľudskými činmi.
Problémy s politikou
Vedecký výskum a monitorovanie biodiverzity sú drahé, preto sa študuje iba malé percento biodiverzity na svete. Ľudia zle chápu súčasný stav biodiverzity a menej chápu, ako vyzerala biodiverzita pred ľudským vplyvom. Presný odhad rozsahu poklesu biodiverzity je preto obmedzený. Z dôvodu nedostatku vedeckých dôkazov, ktoré by mali byť predložené tvorcom politiky, na politickej scéne často chýba podpora prísnych environmentálnych zákonov. Sociálne a ekonomické náklady spojené s právnymi predpismi v oblasti životného prostredia sú pre niektoré odvetvia spoločenstva vyššie, takže implementácia týchto zákonov je spornou otázkou. Z dôvodu týchto ťažkostí sa zákony na ochranu biodiverzity vyvíjajú pomaly a často sú neprimerané.