Процесс производства белка из последовательности ДНК - дезоксирибонуклеиновой кислоты - включает два основных этапа: транскрипцию и трансляцию. Во время транскрипции из матрицы ДНК создается рибонуклеиновая кислота-мессенджер или мРНК. Эта мРНК объединяется с рибосомной РНК, известной как рРНК, и комплексом транспортной РНК, или тРНК, для перевода кода мРНК в аминокислотную последовательность, белок. ДНК состоит из последовательности нуклеотидных оснований. Четыре основания - это аденин, тимин, гуанин и цитозин. Последовательность, в которой эти основания встречаются на цепи ДНК, в конечном итоге кодирует производство определенных белков. После того, как клетка вырабатывает белки, их можно использовать структурно или в различных метаболических процессах.
Создайте транскрипт мРНК последовательности ДНК. Каждая база в ДНК соответствует другой базе. На фотографиях ДНК обычно изображена в виде двойной спирали, причем основания на одной цепи соединяются связями с комплементарными основаниями на противоположной цепи. Дополнительные основания: аденин (A) и тимин (T), а также цитозин (C) и гуанин (G). Итак, если одна цепь ДНК читает A-C-G-C-T-A, то комплементарной цепью является T-G-C-G-A-T. Вы можете найти последовательность транскрипта мРНК таким же образом, используя комплементы оснований, показанные в последовательности ДНК. РНК, однако, не содержит тимина основания (Т); вместо этого это основание заменяется урацилом (U). Когда вы встретите аденин (A) в последовательности ДНК, сравните его с урацилом (U).
Если последовательность ДНК - A-A-T-C-G-C-T-T-A-C-G-A, то последовательность мРНК - U-U-A-G-C-G-A-A-U-G-C-U.
Создайте последовательность тРНК против кодона из транскрипта мРНК. Каждая тРНК имеет набор из трех оснований, известный как антикодон. Антикодон соответствует комплементарным основаниям в последовательности мРНК. Чтобы определить общую антикодоновую последовательность, которая будет соответствовать цепи мРНК, просто повторно транскрибируйте последовательность РНК; другими словами, выпишите дополнительные основы. Используя ранее отмеченную последовательность мРНК, последовательность антикодона тРНК представляет собой A-A-T-C-G-C -U-U-A-C-G-A.
Разбейте найденную последовательность тРНК на трехосновные наборы. Поскольку антикодоны состоят из трех оснований одновременно, лучшим способом записи последовательности антикодонов A-A-T-C-G-C -U-U-A-C-G-A является AAT-CGC-UUA-CGA.
Советы
-
Вы можете найти последовательность антикодонов еще быстрее, просто записав последовательность ДНК, используя U для урацила вместо T для тимина. Затем разделите последовательность на три основных антикодона.
Вы можете использовать антикодоновую последовательность для сопоставления с белками, добавляемыми каждой тРНК во время трансляции, создавая аминокислотную последовательность. Тем не менее убедитесь, что справочная таблица аминокислот, которую вы используете, предназначена для антикодонов (см. Ресурсы). Многие диаграммы аминокислотного секвенирования просто перечисляют совпадающие кодоны мРНК вместо антикодонов тРНК, что позволяет пропустить этап определения последовательности антикодонов.
Последовательность молекулы тРНК - это просто РНК-транскрипция последовательности ДНК, использованной для ее создания.