Возможно, наиболее важным отличием спор плесени от бактериальных эндоспор является то, что плесень классифицируется как так называемые высшие грибы. По сути, они представляют собой то, что биологи называют типом эукариотических клеток. С другой стороны, бактериальные эндоспоры образуются из бактерий, которые - как группа - классифицируются как имеющие тип прокариотических клеток. Различие между прокариотической клеткой и эукариотической клеткой является фундаментальным в биологии. Проще говоря, бактериальная клетка структурно намного проще.
Эукариотические клетки, как и споры плесени, изобилуют комплексом клеточных структур, называемых органеллами. Органеллы выполняют всевозможные клеточные функции, и одна из самых заметных органелл - ядро. Ядро эукариотических клеток спор плесени содержит ДНК, которая позволяет клетке функционировать и воспроизводиться. Это контрастирует с бактериальными эндоспорами, в которых ДНК более или менее свободна в цитоплазме клетки.
Помимо ядра, споровая клетка эукариотической плесени содержит такие органеллы, как эндоплазматический ретикулум или ER. ER по сути похож на лабиринт свернутых мембран, в котором выполняются многие биохимические процессы, жизненно важные для клетки. В спорах плесени ER связан с ядерной оболочкой, мембраной, окружающей ядро клетки. В бактериальных эндоспорах такое расположение отсутствует.
Бактериальные эндоспоры практически не имеют такого уровня клеточной сложности, который присутствует в спорах эукариотической плесени. Еще одно различие между бактериальными эндоспорами и спорами плесени - помимо их фундаментального различия в типах клеток - заключается в той роли, которую они играют в жизнях соответствующих организмов. Бактериальная эндоспора - это устойчивая структура, которая образуется внутри клетки бактерии. В отличие от спор плесени, эндоспора бактерий специально адаптирована к неблагоприятным условиям окружающей среды. Ключевой особенностью бактериальных эндоспор является соединение, называемое дипиколиновой кислотой. Это соединение, хотя и не распространено в спорах плесени, играет важную роль в обеспечении устойчивости бактериальных эндоспор к неблагоприятным условиям окружающей среды.
Между эндоспорами бактерий и спорами плесени существует множество других различий. Большинство из них, опять же, связано с фундаментальным различием между эукариотической и прокариотической клетками. Многие другие органеллы, помимо уже описанных, присутствуют в споре плесени, но отсутствуют в бактериальной эндоспоре. К ним относятся структура, называемая аппаратом Гольджи, и другие, подобные так называемому ядрышку. Ядрышко - это структура в ядре эукариотических клеток, которая активна в синтезе белка, важного для функционирования клетки. Бактериальные эндоспоры выполняют многие из тех же основных жизненных функций, что и споры плесени, но они делают это без преимуществ сложных органелл, присутствующих в споре плесени.