Нефридии, свернутые трубчатыми трубчатыми органами, фильтруют и удаляют отходы из тела дождевого червя. У менее развитых червей, таких как плоский червь или коловратка, нефридии не столь специализированы и расположены в различных клетках по всему телу существа. У более продвинутых сегментированных червей, таких как дождевой червь, нефридии обычно сгруппированы попарно по всем сегментам тела червя. Эти пары нефридий названы в честь их расположения в анатомии червей. У каждой группы есть общие черты, все они являются канализационными отходами, но у каждой также есть отличительные функции.
Нефридии глотки состоят из большого количества нефридий меньшего размера, сгруппированных в три набора парных бивней. Эти сгруппированные нефридии фильтруют азот из скоплений окружающих капилляров. Концы всех глоточных нефридий сходятся и образуют большой канал для отвода сточных вод, который впадает в глотку и ротовую полость, трубку, идущую от рта к глотке.
Септальные нефридии расположены по обе стороны от перегородок - нитевидных структур, которые удерживают кожу к органам, расположенным ниже, - рядами по сорок или пятьдесят отдельных нефридий. Они появляются после 15-го сегмента и впадают в пару выводных протоков, которые ведут в основную полость кишечника. Эта система нефридий отвечает за поддержание водного баланса или осморегуляции у дождевых червей.
Сотни (от 200 до 250 на сегмент) покровных нефридий расположены по всей стенке тела дождевого червя (во всех, кроме первых двух сегментов). Эти крошечные нефридии служат для отвода азотистых отходов изнутри червя во внешнюю почву.