Żywe organizmy są często podzielone na pięć królestw. Organizmy wielokomórkowe należą do trzech z tych królestw: roślin, zwierząt i grzybów. Kingdom Protista zawiera wiele organizmów, które czasami mogą wydawać się wielokomórkowe, takie jak glony, ale organizmom tym brakuje wyrafinowanego zróżnicowania typowo związanego z wielokomórkowymi organizmy. Organizmy w tych królestwach pozornie bardzo się różnią, ale na poziomie komórkowym mają wspólne wiele cech i ogólnie uważa się, że są ze sobą o wiele ściślej powiązane niż w przypadku bakteria.
Eukarionty
Organizmy mogą charakteryzować się cechami komórkowymi jako prokarionty lub eukarionty. Eukarionty posiadają chromosomy liniowe, jądro związane z błoną i złożone organelle. Prokarionty posiadają kolisty chromosom i brak im wyrafinowanych organelli i jądra eukariotycznego. Należy zauważyć, że wszystkie organizmy wielokomórkowe są eukariotami, chociaż nie wszystkie eukarionty są wielokomórkowe.
Królestwo Animalia
Jako członkowie tego królestwa ludzie są na ogół bardzo zaznajomieni z królestwem zwierząt. Oprócz tego, że są wielokomórkowe, zwierzęta są heterotroficzne, nie mają ścian komórkowych i rozwijają się z blastuli – kuli komórek uformowanej na wczesnym etapie rozwoju embrionalnego. Chociaż wiele zwierząt jest dużych, takich jak wieloryby i słonie, niektóre zwierzęta są niezwykle małe, takie jak roztocza żyjące w naszych brwiach. Kilka zwierząt utworzyło symbiotyczne relacje z autotrofami, takimi jak te występujące w koralowcach. Chociaż koralowce są małe indywidualnie, ich wspólne wysiłki przez długi czas stworzyły naprawdę masywne obiekty, takie jak Wielka Rafa Koralowa u wybrzeży Australii.
Kinggrom Plantae
Kingdom Plantae — do których należą mchy, paprocie, drzewa iglaste i rośliny kwitnące — odgrywają znaczącą i fundamentalną rolę w wielu ekosystemach lądowych jako pierwszy krok wielu sieci pokarmowych. Chloroplasty nadają roślinom charakterystyczny zielony kolor i umożliwiają komórkom roślin przekształcanie światła słonecznego, wody i dwutlenku węgla w żywność poprzez fotosyntezę. Inną cechą komórek roślinnych jest ściana komórkowa zbudowana z celulozy. Rośliny wykazują znacznie większą zdolność do rozmnażania bezpłciowego niż zwierzęta. Zdolność tę ilustruje Pando, osika w stanie Utah, która jest organizmem o połączonym systemie korzeniowym i ponad 47 000 łodyg sklonowanych od jednego rodzica. Umożliwiło to Pando przetrwanie sprzed ostatniej epoki lodowcowej.
Królestwo Fungi, ,, ,, ,, ,, ,,, ,,,, ,,,, ,,,, ,,,, ,,,, ,,,, ,,,, ,,,, ,,,, ,,,, ,,,, ,,,, ,,,, ,,,, ,,,, ,,,, ,,,, ,,,, ,,,, ,,,, ,,,, ,,,, ,,,, ,,,, ,
Zarówno jednokomórkowe grzyby używane do produkcji antybiotyków, piwa i sosu sojowego, jak i wersje wielokomórkowe, których owocniki pojawiają się na naszych stekach są heterotroficzne. W przeciwieństwie do zwierząt, które spożywają pokarm i pożywienie, grzyby pobierają energię i składniki odżywcze ze środowiska poprzez wydzielanie enzymów. Grzyby odgrywają ważną rolę w środowisku, rozkładając odpady i martwe ciała innych organizmów. Niektóre grzyby tworzą symbiotyczne relacje z innymi organizmami, jak np. porosty (z glonami) i mikoryzy (na korzeniach roślin). Jednak niektóre grzyby mogą być pasożytnicze.
Królestwo Protista
Można by słusznie scharakteryzować Kingdom Protista jako różnorodną szufladę dla eukariontów. Chociaż wiele protistów jest jednokomórkowych, glony wielokomórkowe są czasami umieszczane w tym królestwie obok glonów jednokomórkowych. Różnice między glonami a roślinami to brak wyspecjalizowanych części ciała. Być może najbardziej żywym przykładem wielokomórkowych glonów są lasy wodorostów morskich na niektórych obszarach przybrzeżnych. Chociaż wodorosty mają części analogiczne do korzeni, łodyg i liści, trzymanie wodorostów brakuje wyrafinowania i specjalizacji, które można znaleźć w tkankach korzeni roślin. Glony często zamieszkują środowiska słodkowodne i morskie, ale przystosowały się również do życia w glebie i porostach. Glony są autotroficzne i wykorzystują fotosyntezę do wytwarzania własnego pożywienia, podobnie jak rośliny.